Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM18

Lsg1, Large subunit GTPase 1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsg1Q3UM18 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lsg1Q3UM18 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lsg1Q3UM18 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lsg1Q3UM18 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lsg1Q3UM18 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lsg1Q3UM18 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lsg1Q3UM18 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lsg1Q3UM18 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lsg1Q3UM18 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lsg1Q3UM18 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lsg1Q3UM18 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lsg1Q3UM18 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Lsg1Q3UM18 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lsg1Q3UM18 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lsg1Q3UM18 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lsg1Q3UM18 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lsg1Q3UM18 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lsg1Q3UM18 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lsg1Q3UM18 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lsg1Q3UM18 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lsg1Q3UM18 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lsg1Q3UM18 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lsg1Q3UM18 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lsg1Q3UM18 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lsg1Q3UM18 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lsg1Q3UM18 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lsg1Q3UM18 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lsg1Q3UM18 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lsg1Q3UM18 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lsg1Q3UM18 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lsg1Q3UM18 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lsg1Q3UM18 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lsg1Q3UM18 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lsg1Q3UM18 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lsg1Q3UM18 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lsg1Q3UM18 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lsg1Q3UM18 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lsg1Q3UM18 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lsg1Q3UM18 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lsg1Q3UM18 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lsg1Q3UM18 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lsg1Q3UM18 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lsg1Q3UM18 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lsg1Q3UM18 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Lsg1Q3UM18 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lsg1Q3UM18 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lsg1Q3UM18 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lsg1Q3UM18 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Lsg1Q3UM18 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lsg1Q3UM18 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lsg1Q3UM18 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lsg1Q3UM18 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lsg1Q3UM18 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lsg1Q3UM18 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lsg1Q3UM18 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lsg1Q3UM18 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lsg1Q3UM18 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lsg1Q3UM18 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lsg1Q3UM18 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lsg1Q3UM18 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lsg1Q3UM18 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lsg1Q3UM18 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lsg1Q3UM18 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lsg1Q3UM18 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lsg1Q3UM18 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Lsg1Q3UM18 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lsg1Q3UM18 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lsg1Q3UM18 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lsg1Q3UM18 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lsg1Q3UM18 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lsg1Q3UM18 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lsg1Q3UM18 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lsg1Q3UM18 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lsg1Q3UM18 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lsg1Q3UM18 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lsg1Q3UM18 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lsg1Q3UM18 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lsg1Q3UM18 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lsg1Q3UM18 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lsg1Q3UM18 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lsg1Q3UM18 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lsg1Q3UM18 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lsg1Q3UM18 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lsg1Q3UM18 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lsg1Q3UM18 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lsg1Q3UM18 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lsg1Q3UM18 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lsg1Q3UM18 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lsg1Q3UM18 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lsg1Q3UM18 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lsg1Q3UM18 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lsg1Q3UM18 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Lsg1Q3UM18 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lsg1Q3UM18 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lsg1Q3UM18 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lsg1Q3UM18 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lsg1Q3UM18 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lsg1Q3UM18 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lsg1Q3UM18 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lsg1Q3UM18 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.4 ms