Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI4

Tmed8, Protein TMED8, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed8Q3UHI4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tmed8Q3UHI4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tmed8Q3UHI4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tmed8Q3UHI4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Tmed8Q3UHI4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tmed8Q3UHI4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tmed8Q3UHI4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tmed8Q3UHI4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tmed8Q3UHI4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tmed8Q3UHI4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tmed8Q3UHI4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tmed8Q3UHI4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tmed8Q3UHI4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Tmed8Q3UHI4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Tmed8Q3UHI4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Tmed8Q3UHI4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Tmed8Q3UHI4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tmed8Q3UHI4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tmed8Q3UHI4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Tmed8Q3UHI4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Tmed8Q3UHI4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tmed8Q3UHI4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tmed8Q3UHI4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Tmed8Q3UHI4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Tmed8Q3UHI4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Tmed8Q3UHI4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tmed8Q3UHI4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tmed8Q3UHI4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tmed8Q3UHI4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Tmed8Q3UHI4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Tmed8Q3UHI4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Tmed8Q3UHI4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tmed8Q3UHI4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tmed8Q3UHI4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tmed8Q3UHI4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tmed8Q3UHI4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tmed8Q3UHI4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tmed8Q3UHI4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tmed8Q3UHI4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tmed8Q3UHI4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tmed8Q3UHI4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tmed8Q3UHI4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tmed8Q3UHI4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tmed8Q3UHI4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tmed8Q3UHI4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tmed8Q3UHI4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tmed8Q3UHI4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tmed8Q3UHI4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tmed8Q3UHI4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tmed8Q3UHI4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tmed8Q3UHI4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tmed8Q3UHI4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tmed8Q3UHI4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tmed8Q3UHI4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tmed8Q3UHI4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tmed8Q3UHI4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tmed8Q3UHI4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tmed8Q3UHI4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tmed8Q3UHI4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tmed8Q3UHI4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tmed8Q3UHI4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tmed8Q3UHI4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tmed8Q3UHI4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tmed8Q3UHI4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Tmed8Q3UHI4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Tmed8Q3UHI4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tmed8Q3UHI4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tmed8Q3UHI4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Tmed8Q3UHI4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tmed8Q3UHI4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tmed8Q3UHI4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tmed8Q3UHI4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tmed8Q3UHI4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tmed8Q3UHI4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tmed8Q3UHI4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tmed8Q3UHI4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tmed8Q3UHI4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tmed8Q3UHI4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tmed8Q3UHI4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tmed8Q3UHI4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tmed8Q3UHI4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tmed8Q3UHI4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tmed8Q3UHI4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Tmed8Q3UHI4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tmed8Q3UHI4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tmed8Q3UHI4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tmed8Q3UHI4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tmed8Q3UHI4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tmed8Q3UHI4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tmed8Q3UHI4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tmed8Q3UHI4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tmed8Q3UHI4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Tmed8Q3UHI4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tmed8Q3UHI4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tmed8Q3UHI4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Tmed8Q3UHI4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tmed8Q3UHI4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tmed8Q3UHI4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tmed8Q3UHI4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tmed8Q3UHI4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms