Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDN3

Gm45902, Predicted gene 45902, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm45902Q3UDN3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm45902Q3UDN3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm45902Q3UDN3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm45902Q3UDN3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm45902Q3UDN3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm45902Q3UDN3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm45902Q3UDN3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm45902Q3UDN3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm45902Q3UDN3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm45902Q3UDN3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm45902Q3UDN3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm45902Q3UDN3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm45902Q3UDN3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm45902Q3UDN3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm45902Q3UDN3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm45902Q3UDN3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm45902Q3UDN3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm45902Q3UDN3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm45902Q3UDN3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm45902Q3UDN3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm45902Q3UDN3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm45902Q3UDN3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm45902Q3UDN3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm45902Q3UDN3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm45902Q3UDN3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm45902Q3UDN3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm45902Q3UDN3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm45902Q3UDN3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm45902Q3UDN3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm45902Q3UDN3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm45902Q3UDN3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm45902Q3UDN3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm45902Q3UDN3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm45902Q3UDN3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm45902Q3UDN3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm45902Q3UDN3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm45902Q3UDN3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm45902Q3UDN3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm45902Q3UDN3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm45902Q3UDN3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm45902Q3UDN3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm45902Q3UDN3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm45902Q3UDN3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm45902Q3UDN3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm45902Q3UDN3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm45902Q3UDN3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm45902Q3UDN3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm45902Q3UDN3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm45902Q3UDN3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm45902Q3UDN3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm45902Q3UDN3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm45902Q3UDN3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm45902Q3UDN3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm45902Q3UDN3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm45902Q3UDN3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm45902Q3UDN3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm45902Q3UDN3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm45902Q3UDN3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm45902Q3UDN3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm45902Q3UDN3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm45902Q3UDN3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm45902Q3UDN3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm45902Q3UDN3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm45902Q3UDN3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm45902Q3UDN3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm45902Q3UDN3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm45902Q3UDN3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm45902Q3UDN3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm45902Q3UDN3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm45902Q3UDN3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm45902Q3UDN3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm45902Q3UDN3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm45902Q3UDN3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm45902Q3UDN3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm45902Q3UDN3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm45902Q3UDN3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm45902Q3UDN3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm45902Q3UDN3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm45902Q3UDN3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm45902Q3UDN3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm45902Q3UDN3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm45902Q3UDN3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm45902Q3UDN3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm45902Q3UDN3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm45902Q3UDN3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm45902Q3UDN3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm45902Q3UDN3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm45902Q3UDN3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm45902Q3UDN3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm45902Q3UDN3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm45902Q3UDN3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm45902Q3UDN3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm45902Q3UDN3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm45902Q3UDN3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm45902Q3UDN3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm45902Q3UDN3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm45902Q3UDN3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm45902Q3UDN3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm45902Q3UDN3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm45902Q3UDN3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms