Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Palb2Q3U0P1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Palb2Q3U0P1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Palb2Q3U0P1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Palb2Q3U0P1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Palb2Q3U0P1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Palb2Q3U0P1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Palb2Q3U0P1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Palb2Q3U0P1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Palb2Q3U0P1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Palb2Q3U0P1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Palb2Q3U0P1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Palb2Q3U0P1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Palb2Q3U0P1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Palb2Q3U0P1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Palb2Q3U0P1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Palb2Q3U0P1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Palb2Q3U0P1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Palb2Q3U0P1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Palb2Q3U0P1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Palb2Q3U0P1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Palb2Q3U0P1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Palb2Q3U0P1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Palb2Q3U0P1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Palb2Q3U0P1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Palb2Q3U0P1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Palb2Q3U0P1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Palb2Q3U0P1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Palb2Q3U0P1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Palb2Q3U0P1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Palb2Q3U0P1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Palb2Q3U0P1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Palb2Q3U0P1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Palb2Q3U0P1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Palb2Q3U0P1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Palb2Q3U0P1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Palb2Q3U0P1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Palb2Q3U0P1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Palb2Q3U0P1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Palb2Q3U0P1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Palb2Q3U0P1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Palb2Q3U0P1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Palb2Q3U0P1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Palb2Q3U0P1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Palb2Q3U0P1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Palb2Q3U0P1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Palb2Q3U0P1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Palb2Q3U0P1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Palb2Q3U0P1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Palb2Q3U0P1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Palb2Q3U0P1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Palb2Q3U0P1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Palb2Q3U0P1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Palb2Q3U0P1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Palb2Q3U0P1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Palb2Q3U0P1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Palb2Q3U0P1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Palb2Q3U0P1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Palb2Q3U0P1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Palb2Q3U0P1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Palb2Q3U0P1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Palb2Q3U0P1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Palb2Q3U0P1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Palb2Q3U0P1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Palb2Q3U0P1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Palb2Q3U0P1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Palb2Q3U0P1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Palb2Q3U0P1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Palb2Q3U0P1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Palb2Q3U0P1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Palb2Q3U0P1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Palb2Q3U0P1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Palb2Q3U0P1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Palb2Q3U0P1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Palb2Q3U0P1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Palb2Q3U0P1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Palb2Q3U0P1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Palb2Q3U0P1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Palb2Q3U0P1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Palb2Q3U0P1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Palb2Q3U0P1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Palb2Q3U0P1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Palb2Q3U0P1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Palb2Q3U0P1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Palb2Q3U0P1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Palb2Q3U0P1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Palb2Q3U0P1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Palb2Q3U0P1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Palb2Q3U0P1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Palb2Q3U0P1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Palb2Q3U0P1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Palb2Q3U0P1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Palb2Q3U0P1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Palb2Q3U0P1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Palb2Q3U0P1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Palb2Q3U0P1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Palb2Q3U0P1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Palb2Q3U0P1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Palb2Q3U0P1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Palb2Q3U0P1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms