Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWF6

Wdr70, WD repeat-containing protein 70, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr70Q3TWF6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Wdr70Q3TWF6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Wdr70Q3TWF6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Wdr70Q3TWF6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Wdr70Q3TWF6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Wdr70Q3TWF6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Wdr70Q3TWF6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Wdr70Q3TWF6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Wdr70Q3TWF6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Wdr70Q3TWF6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Wdr70Q3TWF6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Wdr70Q3TWF6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Wdr70Q3TWF6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Wdr70Q3TWF6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Wdr70Q3TWF6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Wdr70Q3TWF6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Wdr70Q3TWF6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Wdr70Q3TWF6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Wdr70Q3TWF6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Wdr70Q3TWF6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Wdr70Q3TWF6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Wdr70Q3TWF6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Wdr70Q3TWF6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Wdr70Q3TWF6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Wdr70Q3TWF6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Wdr70Q3TWF6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Wdr70Q3TWF6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Wdr70Q3TWF6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Wdr70Q3TWF6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Wdr70Q3TWF6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Wdr70Q3TWF6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Wdr70Q3TWF6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Wdr70Q3TWF6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Wdr70Q3TWF6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Wdr70Q3TWF6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Wdr70Q3TWF6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Wdr70Q3TWF6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Wdr70Q3TWF6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Wdr70Q3TWF6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Wdr70Q3TWF6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Wdr70Q3TWF6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Wdr70Q3TWF6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Wdr70Q3TWF6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Wdr70Q3TWF6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Wdr70Q3TWF6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Wdr70Q3TWF6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Wdr70Q3TWF6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Wdr70Q3TWF6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Wdr70Q3TWF6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Wdr70Q3TWF6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Wdr70Q3TWF6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Wdr70Q3TWF6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Wdr70Q3TWF6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Wdr70Q3TWF6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Wdr70Q3TWF6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Wdr70Q3TWF6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Wdr70Q3TWF6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Wdr70Q3TWF6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Wdr70Q3TWF6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Wdr70Q3TWF6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Wdr70Q3TWF6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Wdr70Q3TWF6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Wdr70Q3TWF6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Wdr70Q3TWF6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Wdr70Q3TWF6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Wdr70Q3TWF6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Wdr70Q3TWF6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Wdr70Q3TWF6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Wdr70Q3TWF6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Wdr70Q3TWF6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Wdr70Q3TWF6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Wdr70Q3TWF6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Wdr70Q3TWF6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Wdr70Q3TWF6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Wdr70Q3TWF6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Wdr70Q3TWF6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Wdr70Q3TWF6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Wdr70Q3TWF6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Wdr70Q3TWF6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Wdr70Q3TWF6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Wdr70Q3TWF6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Wdr70Q3TWF6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Wdr70Q3TWF6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Wdr70Q3TWF6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Wdr70Q3TWF6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Wdr70Q3TWF6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Wdr70Q3TWF6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Wdr70Q3TWF6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Wdr70Q3TWF6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Wdr70Q3TWF6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Wdr70Q3TWF6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Wdr70Q3TWF6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Wdr70Q3TWF6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Wdr70Q3TWF6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Wdr70Q3TWF6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Wdr70Q3TWF6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Wdr70Q3TWF6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Wdr70Q3TWF6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Wdr70Q3TWF6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Wdr70Q3TWF6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms