Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Jmjd8Q3TA59 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Jmjd8Q3TA59 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Jmjd8Q3TA59 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Jmjd8Q3TA59 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Jmjd8Q3TA59 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Jmjd8Q3TA59 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Jmjd8Q3TA59 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Jmjd8Q3TA59 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Jmjd8Q3TA59 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Jmjd8Q3TA59 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Jmjd8Q3TA59 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Jmjd8Q3TA59 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Jmjd8Q3TA59 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Jmjd8Q3TA59 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Jmjd8Q3TA59 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Jmjd8Q3TA59 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Jmjd8Q3TA59 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Jmjd8Q3TA59 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Jmjd8Q3TA59 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Jmjd8Q3TA59 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Jmjd8Q3TA59 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Jmjd8Q3TA59 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Jmjd8Q3TA59 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Jmjd8Q3TA59 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Jmjd8Q3TA59 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Jmjd8Q3TA59 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Jmjd8Q3TA59 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Jmjd8Q3TA59 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Jmjd8Q3TA59 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Jmjd8Q3TA59 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Jmjd8Q3TA59 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Jmjd8Q3TA59 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Jmjd8Q3TA59 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Jmjd8Q3TA59 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Jmjd8Q3TA59 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Jmjd8Q3TA59 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Jmjd8Q3TA59 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Jmjd8Q3TA59 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Jmjd8Q3TA59 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Jmjd8Q3TA59 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Jmjd8Q3TA59 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Jmjd8Q3TA59 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Jmjd8Q3TA59 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Jmjd8Q3TA59 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Jmjd8Q3TA59 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Jmjd8Q3TA59 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Jmjd8Q3TA59 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Jmjd8Q3TA59 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Jmjd8Q3TA59 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Jmjd8Q3TA59 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Jmjd8Q3TA59 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Jmjd8Q3TA59 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Jmjd8Q3TA59 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Jmjd8Q3TA59 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Jmjd8Q3TA59 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Jmjd8Q3TA59 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Jmjd8Q3TA59 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Jmjd8Q3TA59 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Jmjd8Q3TA59 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Jmjd8Q3TA59 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Jmjd8Q3TA59 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Jmjd8Q3TA59 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Jmjd8Q3TA59 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Jmjd8Q3TA59 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Jmjd8Q3TA59 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Jmjd8Q3TA59 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Jmjd8Q3TA59 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Jmjd8Q3TA59 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Jmjd8Q3TA59 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Jmjd8Q3TA59 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Jmjd8Q3TA59 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Jmjd8Q3TA59 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Jmjd8Q3TA59 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Jmjd8Q3TA59 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Jmjd8Q3TA59 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Jmjd8Q3TA59 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Jmjd8Q3TA59 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Jmjd8Q3TA59 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Jmjd8Q3TA59 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Jmjd8Q3TA59 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Jmjd8Q3TA59 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Jmjd8Q3TA59 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Jmjd8Q3TA59 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Jmjd8Q3TA59 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Jmjd8Q3TA59 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Jmjd8Q3TA59 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Jmjd8Q3TA59 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Jmjd8Q3TA59 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Jmjd8Q3TA59 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Jmjd8Q3TA59 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Jmjd8Q3TA59 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Jmjd8Q3TA59 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Jmjd8Q3TA59 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Jmjd8Q3TA59 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Jmjd8Q3TA59 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Jmjd8Q3TA59 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Jmjd8Q3TA59 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Jmjd8Q3TA59 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Jmjd8Q3TA59 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms