Protein–RNA interactions for Protein: Q3T9M1

Mfsd2b, Major facilitator superfamily domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd2bQ3T9M1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mfsd2bQ3T9M1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mfsd2bQ3T9M1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mfsd2bQ3T9M1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mfsd2bQ3T9M1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mfsd2bQ3T9M1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mfsd2bQ3T9M1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mfsd2bQ3T9M1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mfsd2bQ3T9M1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mfsd2bQ3T9M1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mfsd2bQ3T9M1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mfsd2bQ3T9M1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mfsd2bQ3T9M1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mfsd2bQ3T9M1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mfsd2bQ3T9M1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mfsd2bQ3T9M1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mfsd2bQ3T9M1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mfsd2bQ3T9M1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mfsd2bQ3T9M1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mfsd2bQ3T9M1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mfsd2bQ3T9M1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mfsd2bQ3T9M1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mfsd2bQ3T9M1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mfsd2bQ3T9M1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mfsd2bQ3T9M1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mfsd2bQ3T9M1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mfsd2bQ3T9M1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mfsd2bQ3T9M1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mfsd2bQ3T9M1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mfsd2bQ3T9M1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mfsd2bQ3T9M1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mfsd2bQ3T9M1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mfsd2bQ3T9M1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mfsd2bQ3T9M1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mfsd2bQ3T9M1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mfsd2bQ3T9M1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mfsd2bQ3T9M1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mfsd2bQ3T9M1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mfsd2bQ3T9M1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mfsd2bQ3T9M1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mfsd2bQ3T9M1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mfsd2bQ3T9M1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mfsd2bQ3T9M1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mfsd2bQ3T9M1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mfsd2bQ3T9M1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mfsd2bQ3T9M1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mfsd2bQ3T9M1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mfsd2bQ3T9M1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mfsd2bQ3T9M1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mfsd2bQ3T9M1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Mfsd2bQ3T9M1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mfsd2bQ3T9M1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mfsd2bQ3T9M1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mfsd2bQ3T9M1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mfsd2bQ3T9M1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mfsd2bQ3T9M1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Mfsd2bQ3T9M1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mfsd2bQ3T9M1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mfsd2bQ3T9M1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mfsd2bQ3T9M1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mfsd2bQ3T9M1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mfsd2bQ3T9M1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mfsd2bQ3T9M1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mfsd2bQ3T9M1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mfsd2bQ3T9M1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mfsd2bQ3T9M1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mfsd2bQ3T9M1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mfsd2bQ3T9M1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mfsd2bQ3T9M1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mfsd2bQ3T9M1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mfsd2bQ3T9M1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mfsd2bQ3T9M1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mfsd2bQ3T9M1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mfsd2bQ3T9M1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mfsd2bQ3T9M1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mfsd2bQ3T9M1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mfsd2bQ3T9M1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mfsd2bQ3T9M1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mfsd2bQ3T9M1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mfsd2bQ3T9M1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mfsd2bQ3T9M1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mfsd2bQ3T9M1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Mfsd2bQ3T9M1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mfsd2bQ3T9M1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mfsd2bQ3T9M1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mfsd2bQ3T9M1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mfsd2bQ3T9M1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mfsd2bQ3T9M1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mfsd2bQ3T9M1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mfsd2bQ3T9M1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mfsd2bQ3T9M1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mfsd2bQ3T9M1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mfsd2bQ3T9M1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mfsd2bQ3T9M1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mfsd2bQ3T9M1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Mfsd2bQ3T9M1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mfsd2bQ3T9M1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mfsd2bQ3T9M1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mfsd2bQ3T9M1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mfsd2bQ3T9M1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms