Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim71Q1PSW8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim71Q1PSW8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim71Q1PSW8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim71Q1PSW8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim71Q1PSW8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim71Q1PSW8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim71Q1PSW8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Trim71Q1PSW8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim71Q1PSW8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim71Q1PSW8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim71Q1PSW8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim71Q1PSW8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim71Q1PSW8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim71Q1PSW8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim71Q1PSW8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim71Q1PSW8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim71Q1PSW8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim71Q1PSW8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Trim71Q1PSW8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim71Q1PSW8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim71Q1PSW8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim71Q1PSW8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim71Q1PSW8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim71Q1PSW8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim71Q1PSW8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim71Q1PSW8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim71Q1PSW8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim71Q1PSW8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim71Q1PSW8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim71Q1PSW8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim71Q1PSW8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim71Q1PSW8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim71Q1PSW8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim71Q1PSW8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim71Q1PSW8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim71Q1PSW8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim71Q1PSW8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim71Q1PSW8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim71Q1PSW8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim71Q1PSW8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim71Q1PSW8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim71Q1PSW8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim71Q1PSW8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim71Q1PSW8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim71Q1PSW8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim71Q1PSW8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim71Q1PSW8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim71Q1PSW8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim71Q1PSW8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim71Q1PSW8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim71Q1PSW8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim71Q1PSW8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim71Q1PSW8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim71Q1PSW8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim71Q1PSW8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim71Q1PSW8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim71Q1PSW8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim71Q1PSW8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim71Q1PSW8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim71Q1PSW8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim71Q1PSW8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim71Q1PSW8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim71Q1PSW8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim71Q1PSW8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim71Q1PSW8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim71Q1PSW8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim71Q1PSW8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim71Q1PSW8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim71Q1PSW8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim71Q1PSW8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim71Q1PSW8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim71Q1PSW8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim71Q1PSW8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim71Q1PSW8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim71Q1PSW8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim71Q1PSW8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim71Q1PSW8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim71Q1PSW8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim71Q1PSW8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim71Q1PSW8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim71Q1PSW8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim71Q1PSW8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim71Q1PSW8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim71Q1PSW8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim71Q1PSW8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim71Q1PSW8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim71Q1PSW8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim71Q1PSW8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim71Q1PSW8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim71Q1PSW8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim71Q1PSW8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim71Q1PSW8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim71Q1PSW8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim71Q1PSW8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim71Q1PSW8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim71Q1PSW8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim71Q1PSW8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim71Q1PSW8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim71Q1PSW8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
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