Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Sox10Q04888 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sox10Q04888 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sox10Q04888 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sox10Q04888 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sox10Q04888 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sox10Q04888 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sox10Q04888 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sox10Q04888 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sox10Q04888 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sox10Q04888 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sox10Q04888 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Sox10Q04888 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Sox10Q04888 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Sox10Q04888 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sox10Q04888 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sox10Q04888 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sox10Q04888 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sox10Q04888 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sox10Q04888 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sox10Q04888 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sox10Q04888 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sox10Q04888 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sox10Q04888 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sox10Q04888 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sox10Q04888 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sox10Q04888 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sox10Q04888 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Sox10Q04888 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sox10Q04888 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sox10Q04888 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sox10Q04888 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Sox10Q04888 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sox10Q04888 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sox10Q04888 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sox10Q04888 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sox10Q04888 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sox10Q04888 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Sox10Q04888 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sox10Q04888 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sox10Q04888 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sox10Q04888 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sox10Q04888 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sox10Q04888 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Sox10Q04888 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Sox10Q04888 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sox10Q04888 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sox10Q04888 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sox10Q04888 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sox10Q04888 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sox10Q04888 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sox10Q04888 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sox10Q04888 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sox10Q04888 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sox10Q04888 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sox10Q04888 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sox10Q04888 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sox10Q04888 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sox10Q04888 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sox10Q04888 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sox10Q04888 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sox10Q04888 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sox10Q04888 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sox10Q04888 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sox10Q04888 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sox10Q04888 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sox10Q04888 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sox10Q04888 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sox10Q04888 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sox10Q04888 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Sox10Q04888 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sox10Q04888 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sox10Q04888 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sox10Q04888 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sox10Q04888 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sox10Q04888 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sox10Q04888 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sox10Q04888 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sox10Q04888 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sox10Q04888 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sox10Q04888 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sox10Q04888 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sox10Q04888 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sox10Q04888 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sox10Q04888 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sox10Q04888 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sox10Q04888 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sox10Q04888 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sox10Q04888 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sox10Q04888 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sox10Q04888 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sox10Q04888 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sox10Q04888 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sox10Q04888 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sox10Q04888 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sox10Q04888 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sox10Q04888 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sox10Q04888 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sox10Q04888 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sox10Q04888 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms