Protein–RNA interactions for Protein: Q03147

Cdk7, Cyclin-dependent kinase 7, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk7Q03147 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdk7Q03147 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdk7Q03147 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdk7Q03147 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdk7Q03147 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdk7Q03147 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdk7Q03147 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdk7Q03147 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdk7Q03147 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdk7Q03147 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdk7Q03147 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk7Q03147 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk7Q03147 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdk7Q03147 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cdk7Q03147 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdk7Q03147 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdk7Q03147 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdk7Q03147 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdk7Q03147 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdk7Q03147 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdk7Q03147 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdk7Q03147 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdk7Q03147 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdk7Q03147 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdk7Q03147 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdk7Q03147 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdk7Q03147 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdk7Q03147 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdk7Q03147 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk7Q03147 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk7Q03147 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdk7Q03147 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdk7Q03147 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdk7Q03147 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdk7Q03147 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdk7Q03147 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdk7Q03147 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdk7Q03147 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdk7Q03147 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdk7Q03147 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk7Q03147 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk7Q03147 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk7Q03147 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk7Q03147 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdk7Q03147 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdk7Q03147 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdk7Q03147 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdk7Q03147 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdk7Q03147 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdk7Q03147 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk7Q03147 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk7Q03147 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk7Q03147 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk7Q03147 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdk7Q03147 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdk7Q03147 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk7Q03147 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk7Q03147 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdk7Q03147 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk7Q03147 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdk7Q03147 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdk7Q03147 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdk7Q03147 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdk7Q03147 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdk7Q03147 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdk7Q03147 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdk7Q03147 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdk7Q03147 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdk7Q03147 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdk7Q03147 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdk7Q03147 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdk7Q03147 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdk7Q03147 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdk7Q03147 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdk7Q03147 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdk7Q03147 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdk7Q03147 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdk7Q03147 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdk7Q03147 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdk7Q03147 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdk7Q03147 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdk7Q03147 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdk7Q03147 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdk7Q03147 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdk7Q03147 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdk7Q03147 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdk7Q03147 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdk7Q03147 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cdk7Q03147 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdk7Q03147 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdk7Q03147 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdk7Q03147 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdk7Q03147 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdk7Q03147 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdk7Q03147 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdk7Q03147 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdk7Q03147 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdk7Q03147 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk7Q03147 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdk7Q03147 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms