Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gjb4Q02738 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Gjb4Q02738 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gjb4Q02738 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gjb4Q02738 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gjb4Q02738 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gjb4Q02738 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gjb4Q02738 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Gjb4Q02738 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gjb4Q02738 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gjb4Q02738 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gjb4Q02738 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gjb4Q02738 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gjb4Q02738 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Gjb4Q02738 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gjb4Q02738 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gjb4Q02738 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gjb4Q02738 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gjb4Q02738 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gjb4Q02738 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gjb4Q02738 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gjb4Q02738 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gjb4Q02738 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gjb4Q02738 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gjb4Q02738 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gjb4Q02738 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Gjb4Q02738 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gjb4Q02738 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gjb4Q02738 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gjb4Q02738 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gjb4Q02738 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Gjb4Q02738 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gjb4Q02738 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Gjb4Q02738 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gjb4Q02738 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gjb4Q02738 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gjb4Q02738 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gjb4Q02738 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gjb4Q02738 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gjb4Q02738 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gjb4Q02738 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gjb4Q02738 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gjb4Q02738 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gjb4Q02738 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Gjb4Q02738 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gjb4Q02738 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gjb4Q02738 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gjb4Q02738 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gjb4Q02738 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gjb4Q02738 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Gjb4Q02738 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gjb4Q02738 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gjb4Q02738 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gjb4Q02738 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gjb4Q02738 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gjb4Q02738 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gjb4Q02738 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Gjb4Q02738 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gjb4Q02738 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gjb4Q02738 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gjb4Q02738 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gjb4Q02738 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gjb4Q02738 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gjb4Q02738 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gjb4Q02738 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gjb4Q02738 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Gjb4Q02738 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Gjb4Q02738 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gjb4Q02738 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gjb4Q02738 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gjb4Q02738 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gjb4Q02738 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gjb4Q02738 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gjb4Q02738 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gjb4Q02738 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Gjb4Q02738 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gjb4Q02738 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gjb4Q02738 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gjb4Q02738 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gjb4Q02738 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gjb4Q02738 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gjb4Q02738 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gjb4Q02738 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gjb4Q02738 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gjb4Q02738 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gjb4Q02738 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gjb4Q02738 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Gjb4Q02738 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gjb4Q02738 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gjb4Q02738 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gjb4Q02738 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gjb4Q02738 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gjb4Q02738 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gjb4Q02738 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gjb4Q02738 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gjb4Q02738 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gjb4Q02738 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gjb4Q02738 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gjb4Q02738 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gjb4Q02738 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms