Protein–RNA interactions for Protein: Q01965

Ly9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly9Q01965 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ly9Q01965 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ly9Q01965 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ly9Q01965 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ly9Q01965 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ly9Q01965 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ly9Q01965 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ly9Q01965 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ly9Q01965 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ly9Q01965 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ly9Q01965 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ly9Q01965 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Ly9Q01965 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ly9Q01965 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ly9Q01965 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ly9Q01965 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ly9Q01965 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ly9Q01965 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ly9Q01965 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ly9Q01965 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ly9Q01965 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ly9Q01965 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ly9Q01965 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ly9Q01965 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ly9Q01965 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ly9Q01965 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ly9Q01965 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Ly9Q01965 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ly9Q01965 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ly9Q01965 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ly9Q01965 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Ly9Q01965 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ly9Q01965 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ly9Q01965 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ly9Q01965 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ly9Q01965 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ly9Q01965 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ly9Q01965 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ly9Q01965 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ly9Q01965 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ly9Q01965 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ly9Q01965 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ly9Q01965 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ly9Q01965 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ly9Q01965 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ly9Q01965 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ly9Q01965 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Ly9Q01965 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ly9Q01965 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Ly9Q01965 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ly9Q01965 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ly9Q01965 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ly9Q01965 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ly9Q01965 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ly9Q01965 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Ly9Q01965 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ly9Q01965 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ly9Q01965 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ly9Q01965 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ly9Q01965 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ly9Q01965 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ly9Q01965 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ly9Q01965 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ly9Q01965 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ly9Q01965 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ly9Q01965 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ly9Q01965 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ly9Q01965 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ly9Q01965 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ly9Q01965 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ly9Q01965 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ly9Q01965 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ly9Q01965 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ly9Q01965 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ly9Q01965 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ly9Q01965 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Ly9Q01965 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ly9Q01965 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ly9Q01965 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ly9Q01965 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ly9Q01965 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Ly9Q01965 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ly9Q01965 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ly9Q01965 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ly9Q01965 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ly9Q01965 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ly9Q01965 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ly9Q01965 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ly9Q01965 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ly9Q01965 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ly9Q01965 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ly9Q01965 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ly9Q01965 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ly9Q01965 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ly9Q01965 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ly9Q01965 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ly9Q01965 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ly9Q01965 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ly9Q01965 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ly9Q01965 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms