Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
rp9P97762 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
rp9P97762 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
rp9P97762 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
rp9P97762 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
rp9P97762 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
rp9P97762 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
rp9P97762 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
rp9P97762 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
rp9P97762 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
rp9P97762 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
rp9P97762 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
rp9P97762 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
rp9P97762 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
rp9P97762 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
rp9P97762 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
rp9P97762 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
rp9P97762 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
rp9P97762 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
rp9P97762 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
rp9P97762 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
rp9P97762 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
rp9P97762 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
rp9P97762 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
rp9P97762 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
rp9P97762 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
rp9P97762 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
rp9P97762 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
rp9P97762 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
rp9P97762 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
rp9P97762 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
rp9P97762 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
rp9P97762 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
rp9P97762 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
rp9P97762 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
rp9P97762 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
rp9P97762 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
rp9P97762 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
rp9P97762 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
rp9P97762 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
rp9P97762 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
rp9P97762 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
rp9P97762 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
rp9P97762 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
rp9P97762 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
rp9P97762 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
rp9P97762 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
rp9P97762 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
rp9P97762 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
rp9P97762 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
rp9P97762 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
rp9P97762 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
rp9P97762 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
rp9P97762 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
rp9P97762 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
rp9P97762 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
rp9P97762 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
rp9P97762 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
rp9P97762 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
rp9P97762 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
rp9P97762 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
rp9P97762 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
rp9P97762 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
rp9P97762 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
rp9P97762 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
rp9P97762 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
rp9P97762 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
rp9P97762 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
rp9P97762 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
rp9P97762 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
rp9P97762 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
rp9P97762 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
rp9P97762 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
rp9P97762 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
rp9P97762 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
rp9P97762 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
rp9P97762 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
rp9P97762 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
rp9P97762 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
rp9P97762 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
rp9P97762 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
rp9P97762 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
rp9P97762 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
rp9P97762 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
rp9P97762 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
rp9P97762 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
rp9P97762 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
rp9P97762 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
rp9P97762 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
rp9P97762 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
rp9P97762 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
rp9P97762 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
rp9P97762 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
rp9P97762 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
rp9P97762 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
rp9P97762 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
rp9P97762 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
rp9P97762 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
rp9P97762 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
rp9P97762 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms