Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vamp7P70280 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vamp7P70280 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vamp7P70280 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vamp7P70280 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vamp7P70280 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vamp7P70280 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vamp7P70280 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Vamp7P70280 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Vamp7P70280 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Vamp7P70280 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vamp7P70280 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vamp7P70280 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vamp7P70280 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vamp7P70280 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vamp7P70280 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Vamp7P70280 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Vamp7P70280 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vamp7P70280 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vamp7P70280 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vamp7P70280 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vamp7P70280 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vamp7P70280 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vamp7P70280 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vamp7P70280 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vamp7P70280 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vamp7P70280 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vamp7P70280 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vamp7P70280 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vamp7P70280 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vamp7P70280 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Vamp7P70280 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vamp7P70280 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vamp7P70280 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vamp7P70280 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vamp7P70280 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vamp7P70280 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vamp7P70280 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Vamp7P70280 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Vamp7P70280 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Vamp7P70280 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vamp7P70280 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vamp7P70280 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Vamp7P70280 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Vamp7P70280 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Vamp7P70280 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Vamp7P70280 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Vamp7P70280 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Vamp7P70280 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Vamp7P70280 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Vamp7P70280 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Vamp7P70280 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Vamp7P70280 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Vamp7P70280 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vamp7P70280 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Vamp7P70280 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Vamp7P70280 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vamp7P70280 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vamp7P70280 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vamp7P70280 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Vamp7P70280 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vamp7P70280 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Vamp7P70280 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Vamp7P70280 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Vamp7P70280 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Vamp7P70280 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vamp7P70280 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vamp7P70280 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Vamp7P70280 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vamp7P70280 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vamp7P70280 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vamp7P70280 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vamp7P70280 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Vamp7P70280 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vamp7P70280 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vamp7P70280 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vamp7P70280 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vamp7P70280 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vamp7P70280 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vamp7P70280 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vamp7P70280 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vamp7P70280 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vamp7P70280 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Vamp7P70280 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vamp7P70280 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vamp7P70280 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vamp7P70280 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Vamp7P70280 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vamp7P70280 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Vamp7P70280 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vamp7P70280 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vamp7P70280 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vamp7P70280 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vamp7P70280 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vamp7P70280 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vamp7P70280 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vamp7P70280 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vamp7P70280 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vamp7P70280 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Vamp7P70280 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms