Protein–RNA interactions for Protein: P70188

Kifap3, Kinesin-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kifap3P70188 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kifap3P70188 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kifap3P70188 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kifap3P70188 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Kifap3P70188 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Kifap3P70188 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kifap3P70188 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kifap3P70188 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kifap3P70188 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kifap3P70188 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kifap3P70188 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kifap3P70188 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kifap3P70188 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kifap3P70188 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Kifap3P70188 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Kifap3P70188 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Kifap3P70188 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kifap3P70188 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Kifap3P70188 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kifap3P70188 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Kifap3P70188 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Kifap3P70188 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kifap3P70188 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kifap3P70188 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kifap3P70188 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Kifap3P70188 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kifap3P70188 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kifap3P70188 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kifap3P70188 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Kifap3P70188 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Kifap3P70188 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kifap3P70188 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Kifap3P70188 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Kifap3P70188 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Kifap3P70188 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kifap3P70188 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kifap3P70188 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kifap3P70188 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Kifap3P70188 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kifap3P70188 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kifap3P70188 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kifap3P70188 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Kifap3P70188 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kifap3P70188 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kifap3P70188 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kifap3P70188 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Kifap3P70188 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kifap3P70188 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Kifap3P70188 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kifap3P70188 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kifap3P70188 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kifap3P70188 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kifap3P70188 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kifap3P70188 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kifap3P70188 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kifap3P70188 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kifap3P70188 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kifap3P70188 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kifap3P70188 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kifap3P70188 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Kifap3P70188 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Kifap3P70188 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kifap3P70188 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kifap3P70188 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kifap3P70188 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Kifap3P70188 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kifap3P70188 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kifap3P70188 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Kifap3P70188 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kifap3P70188 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kifap3P70188 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kifap3P70188 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Kifap3P70188 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Kifap3P70188 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Kifap3P70188 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kifap3P70188 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kifap3P70188 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kifap3P70188 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kifap3P70188 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kifap3P70188 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kifap3P70188 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kifap3P70188 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Kifap3P70188 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kifap3P70188 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kifap3P70188 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kifap3P70188 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kifap3P70188 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Kifap3P70188 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kifap3P70188 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kifap3P70188 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kifap3P70188 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kifap3P70188 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Kifap3P70188 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kifap3P70188 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Kifap3P70188 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kifap3P70188 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kifap3P70188 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kifap3P70188 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kifap3P70188 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kifap3P70188 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms