Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp46P62069 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp46P62069 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp46P62069 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp46P62069 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp46P62069 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp46P62069 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp46P62069 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp46P62069 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Usp46P62069 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp46P62069 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp46P62069 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp46P62069 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp46P62069 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp46P62069 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp46P62069 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp46P62069 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp46P62069 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp46P62069 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp46P62069 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp46P62069 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp46P62069 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp46P62069 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp46P62069 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp46P62069 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp46P62069 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp46P62069 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp46P62069 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp46P62069 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp46P62069 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp46P62069 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp46P62069 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp46P62069 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Usp46P62069 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp46P62069 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp46P62069 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp46P62069 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp46P62069 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp46P62069 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp46P62069 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp46P62069 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp46P62069 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp46P62069 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp46P62069 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp46P62069 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp46P62069 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp46P62069 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Usp46P62069 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Usp46P62069 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp46P62069 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp46P62069 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp46P62069 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp46P62069 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp46P62069 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp46P62069 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp46P62069 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp46P62069 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp46P62069 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp46P62069 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp46P62069 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp46P62069 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp46P62069 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp46P62069 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp46P62069 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp46P62069 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp46P62069 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp46P62069 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp46P62069 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp46P62069 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp46P62069 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp46P62069 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp46P62069 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp46P62069 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp46P62069 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp46P62069 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp46P62069 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp46P62069 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp46P62069 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp46P62069 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp46P62069 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp46P62069 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp46P62069 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp46P62069 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp46P62069 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp46P62069 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp46P62069 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp46P62069 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp46P62069 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp46P62069 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp46P62069 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Usp46P62069 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp46P62069 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp46P62069 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp46P62069 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp46P62069 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp46P62069 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp46P62069 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp46P62069 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp46P62069 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp46P62069 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms