Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Dpf3P58269 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Dpf3P58269 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Dpf3P58269 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Dpf3P58269 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Dpf3P58269 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Dpf3P58269 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Dpf3P58269 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Dpf3P58269 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Dpf3P58269 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Dpf3P58269 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Dpf3P58269 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dpf3P58269 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dpf3P58269 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Dpf3P58269 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Dpf3P58269 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Dpf3P58269 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Dpf3P58269 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Dpf3P58269 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Dpf3P58269 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Dpf3P58269 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Dpf3P58269 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Dpf3P58269 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Dpf3P58269 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Dpf3P58269 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dpf3P58269 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dpf3P58269 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Dpf3P58269 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Dpf3P58269 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Dpf3P58269 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Dpf3P58269 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Dpf3P58269 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Dpf3P58269 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Dpf3P58269 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Dpf3P58269 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Dpf3P58269 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Dpf3P58269 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Dpf3P58269 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Dpf3P58269 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Dpf3P58269 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Dpf3P58269 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Dpf3P58269 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Dpf3P58269 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Dpf3P58269 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Dpf3P58269 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Dpf3P58269 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Dpf3P58269 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Dpf3P58269 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Dpf3P58269 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Dpf3P58269 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Dpf3P58269 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Dpf3P58269 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Dpf3P58269 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Dpf3P58269 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Dpf3P58269 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Dpf3P58269 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Dpf3P58269 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Dpf3P58269 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Dpf3P58269 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Dpf3P58269 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Dpf3P58269 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Dpf3P58269 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Dpf3P58269 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Dpf3P58269 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Dpf3P58269 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Dpf3P58269 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Dpf3P58269 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Dpf3P58269 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Dpf3P58269 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Dpf3P58269 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Dpf3P58269 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Dpf3P58269 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Dpf3P58269 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Dpf3P58269 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Dpf3P58269 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Dpf3P58269 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Dpf3P58269 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Dpf3P58269 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Dpf3P58269 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Dpf3P58269 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dpf3P58269 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dpf3P58269 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Dpf3P58269 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Dpf3P58269 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Dpf3P58269 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Dpf3P58269 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Dpf3P58269 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Dpf3P58269 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Dpf3P58269 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Dpf3P58269 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Dpf3P58269 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Dpf3P58269 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Dpf3P58269 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Dpf3P58269 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Dpf3P58269 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Dpf3P58269 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Dpf3P58269 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Dpf3P58269 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Dpf3P58269 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Dpf3P58269 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms