Protein–RNA interactions for Protein: P58021

Tm9sf2, Transmembrane 9 superfamily member 2, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf2P58021 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tm9sf2P58021 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tm9sf2P58021 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tm9sf2P58021 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tm9sf2P58021 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tm9sf2P58021 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tm9sf2P58021 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tm9sf2P58021 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tm9sf2P58021 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tm9sf2P58021 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tm9sf2P58021 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tm9sf2P58021 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tm9sf2P58021 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tm9sf2P58021 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tm9sf2P58021 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tm9sf2P58021 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tm9sf2P58021 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tm9sf2P58021 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tm9sf2P58021 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tm9sf2P58021 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tm9sf2P58021 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tm9sf2P58021 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tm9sf2P58021 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tm9sf2P58021 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tm9sf2P58021 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Tm9sf2P58021 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tm9sf2P58021 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tm9sf2P58021 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tm9sf2P58021 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tm9sf2P58021 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Tm9sf2P58021 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tm9sf2P58021 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Tm9sf2P58021 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tm9sf2P58021 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tm9sf2P58021 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tm9sf2P58021 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tm9sf2P58021 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tm9sf2P58021 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tm9sf2P58021 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tm9sf2P58021 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tm9sf2P58021 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tm9sf2P58021 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tm9sf2P58021 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tm9sf2P58021 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tm9sf2P58021 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tm9sf2P58021 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tm9sf2P58021 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tm9sf2P58021 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tm9sf2P58021 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tm9sf2P58021 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tm9sf2P58021 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tm9sf2P58021 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tm9sf2P58021 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tm9sf2P58021 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tm9sf2P58021 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tm9sf2P58021 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tm9sf2P58021 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tm9sf2P58021 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tm9sf2P58021 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tm9sf2P58021 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tm9sf2P58021 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tm9sf2P58021 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tm9sf2P58021 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tm9sf2P58021 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Tm9sf2P58021 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tm9sf2P58021 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tm9sf2P58021 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tm9sf2P58021 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tm9sf2P58021 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tm9sf2P58021 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tm9sf2P58021 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tm9sf2P58021 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tm9sf2P58021 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tm9sf2P58021 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tm9sf2P58021 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tm9sf2P58021 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tm9sf2P58021 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Tm9sf2P58021 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tm9sf2P58021 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tm9sf2P58021 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tm9sf2P58021 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tm9sf2P58021 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tm9sf2P58021 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tm9sf2P58021 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tm9sf2P58021 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tm9sf2P58021 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tm9sf2P58021 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tm9sf2P58021 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tm9sf2P58021 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tm9sf2P58021 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tm9sf2P58021 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tm9sf2P58021 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tm9sf2P58021 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tm9sf2P58021 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tm9sf2P58021 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tm9sf2P58021 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tm9sf2P58021 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tm9sf2P58021 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tm9sf2P58021 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tm9sf2P58021 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms