Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CtnsP57757 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CtnsP57757 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CtnsP57757 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CtnsP57757 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CtnsP57757 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CtnsP57757 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CtnsP57757 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CtnsP57757 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CtnsP57757 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CtnsP57757 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CtnsP57757 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CtnsP57757 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CtnsP57757 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CtnsP57757 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CtnsP57757 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CtnsP57757 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CtnsP57757 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CtnsP57757 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CtnsP57757 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CtnsP57757 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CtnsP57757 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CtnsP57757 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CtnsP57757 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CtnsP57757 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CtnsP57757 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CtnsP57757 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CtnsP57757 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CtnsP57757 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CtnsP57757 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CtnsP57757 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CtnsP57757 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CtnsP57757 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CtnsP57757 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CtnsP57757 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CtnsP57757 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CtnsP57757 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CtnsP57757 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CtnsP57757 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CtnsP57757 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CtnsP57757 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CtnsP57757 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CtnsP57757 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CtnsP57757 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CtnsP57757 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CtnsP57757 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CtnsP57757 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CtnsP57757 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CtnsP57757 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CtnsP57757 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CtnsP57757 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CtnsP57757 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CtnsP57757 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CtnsP57757 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CtnsP57757 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CtnsP57757 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CtnsP57757 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CtnsP57757 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CtnsP57757 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CtnsP57757 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CtnsP57757 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CtnsP57757 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CtnsP57757 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CtnsP57757 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CtnsP57757 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CtnsP57757 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CtnsP57757 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CtnsP57757 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CtnsP57757 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CtnsP57757 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CtnsP57757 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CtnsP57757 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CtnsP57757 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CtnsP57757 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CtnsP57757 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CtnsP57757 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CtnsP57757 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CtnsP57757 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CtnsP57757 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CtnsP57757 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CtnsP57757 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CtnsP57757 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CtnsP57757 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CtnsP57757 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CtnsP57757 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CtnsP57757 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CtnsP57757 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CtnsP57757 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CtnsP57757 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CtnsP57757 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CtnsP57757 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CtnsP57757 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CtnsP57757 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CtnsP57757 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CtnsP57757 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CtnsP57757 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CtnsP57757 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CtnsP57757 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CtnsP57757 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CtnsP57757 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms