Protein–RNA interactions for Protein: P57724

Pcbp4, Poly(rC)-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp4P57724 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcbp4P57724 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcbp4P57724 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcbp4P57724 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcbp4P57724 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcbp4P57724 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcbp4P57724 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcbp4P57724 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcbp4P57724 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcbp4P57724 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcbp4P57724 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcbp4P57724 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcbp4P57724 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcbp4P57724 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcbp4P57724 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcbp4P57724 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcbp4P57724 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcbp4P57724 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcbp4P57724 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcbp4P57724 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcbp4P57724 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcbp4P57724 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcbp4P57724 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcbp4P57724 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcbp4P57724 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcbp4P57724 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcbp4P57724 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcbp4P57724 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcbp4P57724 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcbp4P57724 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcbp4P57724 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcbp4P57724 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcbp4P57724 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcbp4P57724 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcbp4P57724 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcbp4P57724 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcbp4P57724 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcbp4P57724 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcbp4P57724 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcbp4P57724 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcbp4P57724 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcbp4P57724 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcbp4P57724 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcbp4P57724 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcbp4P57724 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcbp4P57724 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcbp4P57724 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcbp4P57724 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcbp4P57724 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcbp4P57724 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcbp4P57724 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcbp4P57724 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcbp4P57724 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcbp4P57724 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcbp4P57724 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcbp4P57724 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcbp4P57724 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcbp4P57724 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcbp4P57724 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcbp4P57724 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcbp4P57724 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcbp4P57724 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcbp4P57724 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcbp4P57724 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcbp4P57724 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcbp4P57724 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcbp4P57724 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcbp4P57724 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcbp4P57724 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcbp4P57724 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcbp4P57724 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcbp4P57724 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcbp4P57724 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcbp4P57724 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcbp4P57724 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcbp4P57724 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcbp4P57724 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcbp4P57724 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcbp4P57724 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcbp4P57724 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcbp4P57724 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcbp4P57724 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcbp4P57724 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcbp4P57724 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcbp4P57724 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcbp4P57724 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcbp4P57724 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcbp4P57724 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcbp4P57724 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcbp4P57724 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcbp4P57724 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcbp4P57724 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcbp4P57724 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcbp4P57724 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcbp4P57724 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcbp4P57724 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcbp4P57724 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcbp4P57724 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcbp4P57724 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcbp4P57724 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms