Protein–RNA interactions for Protein: P55105

Bmp8b, Bone morphogenetic protein 8B, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp8bP55105 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bmp8bP55105 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bmp8bP55105 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bmp8bP55105 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bmp8bP55105 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bmp8bP55105 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bmp8bP55105 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bmp8bP55105 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bmp8bP55105 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bmp8bP55105 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bmp8bP55105 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bmp8bP55105 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bmp8bP55105 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bmp8bP55105 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bmp8bP55105 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bmp8bP55105 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bmp8bP55105 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bmp8bP55105 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bmp8bP55105 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bmp8bP55105 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bmp8bP55105 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bmp8bP55105 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Bmp8bP55105 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bmp8bP55105 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bmp8bP55105 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bmp8bP55105 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Bmp8bP55105 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bmp8bP55105 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bmp8bP55105 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bmp8bP55105 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Bmp8bP55105 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bmp8bP55105 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bmp8bP55105 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Bmp8bP55105 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bmp8bP55105 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bmp8bP55105 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bmp8bP55105 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bmp8bP55105 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bmp8bP55105 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bmp8bP55105 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bmp8bP55105 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bmp8bP55105 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bmp8bP55105 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bmp8bP55105 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bmp8bP55105 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bmp8bP55105 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bmp8bP55105 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bmp8bP55105 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bmp8bP55105 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bmp8bP55105 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bmp8bP55105 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bmp8bP55105 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bmp8bP55105 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bmp8bP55105 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bmp8bP55105 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bmp8bP55105 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bmp8bP55105 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bmp8bP55105 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Bmp8bP55105 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bmp8bP55105 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Bmp8bP55105 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bmp8bP55105 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bmp8bP55105 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bmp8bP55105 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bmp8bP55105 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bmp8bP55105 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bmp8bP55105 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bmp8bP55105 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bmp8bP55105 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bmp8bP55105 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bmp8bP55105 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bmp8bP55105 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bmp8bP55105 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bmp8bP55105 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bmp8bP55105 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bmp8bP55105 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bmp8bP55105 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bmp8bP55105 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bmp8bP55105 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bmp8bP55105 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bmp8bP55105 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bmp8bP55105 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bmp8bP55105 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Bmp8bP55105 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Bmp8bP55105 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Bmp8bP55105 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bmp8bP55105 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bmp8bP55105 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bmp8bP55105 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bmp8bP55105 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bmp8bP55105 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bmp8bP55105 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bmp8bP55105 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bmp8bP55105 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bmp8bP55105 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bmp8bP55105 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bmp8bP55105 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bmp8bP55105 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bmp8bP55105 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bmp8bP55105 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms