Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NrlP54846 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NrlP54846 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NrlP54846 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NrlP54846 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NrlP54846 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NrlP54846 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NrlP54846 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NrlP54846 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NrlP54846 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NrlP54846 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NrlP54846 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NrlP54846 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NrlP54846 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NrlP54846 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NrlP54846 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NrlP54846 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NrlP54846 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NrlP54846 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NrlP54846 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NrlP54846 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
NrlP54846 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NrlP54846 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NrlP54846 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NrlP54846 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NrlP54846 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NrlP54846 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NrlP54846 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NrlP54846 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NrlP54846 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NrlP54846 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NrlP54846 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NrlP54846 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NrlP54846 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NrlP54846 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NrlP54846 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NrlP54846 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NrlP54846 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NrlP54846 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NrlP54846 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NrlP54846 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NrlP54846 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NrlP54846 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NrlP54846 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NrlP54846 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NrlP54846 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NrlP54846 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NrlP54846 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NrlP54846 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NrlP54846 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NrlP54846 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NrlP54846 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NrlP54846 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NrlP54846 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NrlP54846 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NrlP54846 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NrlP54846 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NrlP54846 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NrlP54846 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NrlP54846 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NrlP54846 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NrlP54846 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NrlP54846 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NrlP54846 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NrlP54846 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NrlP54846 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NrlP54846 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NrlP54846 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NrlP54846 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NrlP54846 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NrlP54846 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NrlP54846 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NrlP54846 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NrlP54846 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NrlP54846 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NrlP54846 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NrlP54846 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NrlP54846 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NrlP54846 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NrlP54846 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NrlP54846 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NrlP54846 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NrlP54846 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NrlP54846 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NrlP54846 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NrlP54846 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NrlP54846 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NrlP54846 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NrlP54846 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NrlP54846 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NrlP54846 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NrlP54846 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NrlP54846 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NrlP54846 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NrlP54846 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NrlP54846 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NrlP54846 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NrlP54846 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NrlP54846 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NrlP54846 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms