Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cacnb3P54285 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cacnb3P54285 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Cacnb3P54285 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Cacnb3P54285 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cacnb3P54285 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cacnb3P54285 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Cacnb3P54285 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cacnb3P54285 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cacnb3P54285 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cacnb3P54285 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Cacnb3P54285 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cacnb3P54285 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cacnb3P54285 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Cacnb3P54285 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cacnb3P54285 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cacnb3P54285 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cacnb3P54285 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cacnb3P54285 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cacnb3P54285 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cacnb3P54285 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cacnb3P54285 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cacnb3P54285 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cacnb3P54285 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cacnb3P54285 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cacnb3P54285 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cacnb3P54285 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cacnb3P54285 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cacnb3P54285 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cacnb3P54285 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cacnb3P54285 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cacnb3P54285 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cacnb3P54285 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cacnb3P54285 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cacnb3P54285 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cacnb3P54285 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Cacnb3P54285 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cacnb3P54285 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cacnb3P54285 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cacnb3P54285 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cacnb3P54285 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cacnb3P54285 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cacnb3P54285 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cacnb3P54285 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cacnb3P54285 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cacnb3P54285 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cacnb3P54285 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cacnb3P54285 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cacnb3P54285 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cacnb3P54285 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cacnb3P54285 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cacnb3P54285 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cacnb3P54285 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cacnb3P54285 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cacnb3P54285 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cacnb3P54285 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cacnb3P54285 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cacnb3P54285 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Cacnb3P54285 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cacnb3P54285 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cacnb3P54285 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cacnb3P54285 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cacnb3P54285 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cacnb3P54285 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cacnb3P54285 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cacnb3P54285 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cacnb3P54285 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cacnb3P54285 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cacnb3P54285 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cacnb3P54285 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cacnb3P54285 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cacnb3P54285 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cacnb3P54285 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cacnb3P54285 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cacnb3P54285 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cacnb3P54285 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cacnb3P54285 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cacnb3P54285 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cacnb3P54285 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cacnb3P54285 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cacnb3P54285 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cacnb3P54285 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cacnb3P54285 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cacnb3P54285 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Cacnb3P54285 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cacnb3P54285 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cacnb3P54285 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cacnb3P54285 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cacnb3P54285 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cacnb3P54285 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cacnb3P54285 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cacnb3P54285 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cacnb3P54285 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cacnb3P54285 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cacnb3P54285 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cacnb3P54285 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cacnb3P54285 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cacnb3P54285 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cacnb3P54285 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cacnb3P54285 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms