Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lbx1P52955 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lbx1P52955 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lbx1P52955 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lbx1P52955 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lbx1P52955 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lbx1P52955 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lbx1P52955 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lbx1P52955 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Lbx1P52955 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lbx1P52955 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lbx1P52955 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lbx1P52955 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lbx1P52955 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lbx1P52955 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lbx1P52955 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lbx1P52955 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lbx1P52955 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lbx1P52955 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lbx1P52955 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lbx1P52955 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lbx1P52955 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lbx1P52955 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lbx1P52955 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lbx1P52955 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lbx1P52955 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lbx1P52955 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lbx1P52955 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lbx1P52955 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lbx1P52955 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Lbx1P52955 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lbx1P52955 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lbx1P52955 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lbx1P52955 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lbx1P52955 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lbx1P52955 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lbx1P52955 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lbx1P52955 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lbx1P52955 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lbx1P52955 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lbx1P52955 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lbx1P52955 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lbx1P52955 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lbx1P52955 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lbx1P52955 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lbx1P52955 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lbx1P52955 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lbx1P52955 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lbx1P52955 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lbx1P52955 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lbx1P52955 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lbx1P52955 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Lbx1P52955 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Lbx1P52955 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lbx1P52955 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Lbx1P52955 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Lbx1P52955 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lbx1P52955 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lbx1P52955 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lbx1P52955 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lbx1P52955 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lbx1P52955 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lbx1P52955 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lbx1P52955 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lbx1P52955 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Lbx1P52955 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lbx1P52955 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lbx1P52955 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lbx1P52955 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lbx1P52955 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lbx1P52955 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lbx1P52955 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lbx1P52955 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lbx1P52955 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lbx1P52955 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lbx1P52955 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lbx1P52955 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lbx1P52955 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lbx1P52955 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lbx1P52955 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lbx1P52955 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lbx1P52955 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lbx1P52955 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lbx1P52955 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lbx1P52955 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lbx1P52955 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lbx1P52955 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lbx1P52955 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lbx1P52955 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lbx1P52955 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lbx1P52955 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lbx1P52955 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lbx1P52955 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lbx1P52955 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lbx1P52955 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lbx1P52955 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lbx1P52955 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lbx1P52955 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lbx1P52955 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Lbx1P52955 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
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