Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Fgd1P52734 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Fgd1P52734 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Fgd1P52734 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Fgd1P52734 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Fgd1P52734 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Fgd1P52734 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Fgd1P52734 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Fgd1P52734 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Fgd1P52734 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Fgd1P52734 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Fgd1P52734 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Fgd1P52734 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Fgd1P52734 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Fgd1P52734 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Fgd1P52734 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Fgd1P52734 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Fgd1P52734 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Fgd1P52734 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Fgd1P52734 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Fgd1P52734 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Fgd1P52734 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Fgd1P52734 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Fgd1P52734 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Fgd1P52734 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Fgd1P52734 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Fgd1P52734 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Fgd1P52734 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Fgd1P52734 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Fgd1P52734 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Fgd1P52734 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Fgd1P52734 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Fgd1P52734 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Fgd1P52734 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Fgd1P52734 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Fgd1P52734 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Fgd1P52734 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Fgd1P52734 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Fgd1P52734 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Fgd1P52734 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Fgd1P52734 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
Fgd1P52734 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Fgd1P52734 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Fgd1P52734 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Fgd1P52734 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Fgd1P52734 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Fgd1P52734 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Fgd1P52734 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Fgd1P52734 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Fgd1P52734 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Fgd1P52734 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Fgd1P52734 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Fgd1P52734 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Fgd1P52734 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Fgd1P52734 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Fgd1P52734 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Fgd1P52734 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Fgd1P52734 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
Fgd1P52734 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Fgd1P52734 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Fgd1P52734 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Fgd1P52734 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Fgd1P52734 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Fgd1P52734 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Fgd1P52734 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Fgd1P52734 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Fgd1P52734 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Fgd1P52734 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Fgd1P52734 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Fgd1P52734 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Fgd1P52734 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Fgd1P52734 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Fgd1P52734 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Fgd1P52734 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Fgd1P52734 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Fgd1P52734 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Fgd1P52734 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Fgd1P52734 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Fgd1P52734 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Fgd1P52734 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Fgd1P52734 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Fgd1P52734 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Fgd1P52734 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Fgd1P52734 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Fgd1P52734 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Fgd1P52734 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Fgd1P52734 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Fgd1P52734 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Fgd1P52734 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Fgd1P52734 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Fgd1P52734 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Fgd1P52734 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Fgd1P52734 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Fgd1P52734 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Fgd1P52734 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Fgd1P52734 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Fgd1P52734 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Fgd1P52734 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Fgd1P52734 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Fgd1P52734 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms