Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RoraP51448 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RoraP51448 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RoraP51448 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RoraP51448 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RoraP51448 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RoraP51448 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RoraP51448 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RoraP51448 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RoraP51448 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RoraP51448 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RoraP51448 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RoraP51448 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RoraP51448 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RoraP51448 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RoraP51448 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RoraP51448 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RoraP51448 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RoraP51448 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RoraP51448 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RoraP51448 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RoraP51448 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RoraP51448 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RoraP51448 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RoraP51448 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RoraP51448 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RoraP51448 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RoraP51448 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RoraP51448 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RoraP51448 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RoraP51448 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RoraP51448 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RoraP51448 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RoraP51448 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RoraP51448 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RoraP51448 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RoraP51448 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RoraP51448 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RoraP51448 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RoraP51448 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RoraP51448 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RoraP51448 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RoraP51448 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RoraP51448 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RoraP51448 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RoraP51448 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RoraP51448 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RoraP51448 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RoraP51448 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RoraP51448 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RoraP51448 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RoraP51448 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RoraP51448 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RoraP51448 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RoraP51448 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RoraP51448 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RoraP51448 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RoraP51448 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RoraP51448 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RoraP51448 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RoraP51448 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RoraP51448 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RoraP51448 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RoraP51448 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RoraP51448 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RoraP51448 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RoraP51448 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RoraP51448 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RoraP51448 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RoraP51448 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RoraP51448 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RoraP51448 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RoraP51448 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RoraP51448 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RoraP51448 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RoraP51448 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RoraP51448 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RoraP51448 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RoraP51448 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RoraP51448 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RoraP51448 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RoraP51448 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RoraP51448 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RoraP51448 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RoraP51448 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RoraP51448 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RoraP51448 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RoraP51448 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RoraP51448 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RoraP51448 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RoraP51448 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RoraP51448 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RoraP51448 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RoraP51448 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RoraP51448 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RoraP51448 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RoraP51448 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RoraP51448 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RoraP51448 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RoraP51448 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 565.1 ms