Protein–RNA interactions for Protein: P49586

Pcyt1a, Choline-phosphate cytidylyltransferase A, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcyt1aP49586 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcyt1aP49586 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcyt1aP49586 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcyt1aP49586 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcyt1aP49586 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcyt1aP49586 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcyt1aP49586 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcyt1aP49586 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcyt1aP49586 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcyt1aP49586 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcyt1aP49586 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcyt1aP49586 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcyt1aP49586 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcyt1aP49586 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcyt1aP49586 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcyt1aP49586 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcyt1aP49586 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcyt1aP49586 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcyt1aP49586 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcyt1aP49586 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcyt1aP49586 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcyt1aP49586 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcyt1aP49586 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcyt1aP49586 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcyt1aP49586 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcyt1aP49586 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcyt1aP49586 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcyt1aP49586 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcyt1aP49586 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcyt1aP49586 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcyt1aP49586 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcyt1aP49586 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcyt1aP49586 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcyt1aP49586 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcyt1aP49586 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcyt1aP49586 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcyt1aP49586 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcyt1aP49586 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcyt1aP49586 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcyt1aP49586 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcyt1aP49586 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcyt1aP49586 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcyt1aP49586 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcyt1aP49586 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcyt1aP49586 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcyt1aP49586 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcyt1aP49586 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcyt1aP49586 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcyt1aP49586 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcyt1aP49586 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcyt1aP49586 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcyt1aP49586 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcyt1aP49586 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcyt1aP49586 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcyt1aP49586 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcyt1aP49586 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcyt1aP49586 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcyt1aP49586 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcyt1aP49586 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcyt1aP49586 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcyt1aP49586 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcyt1aP49586 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcyt1aP49586 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcyt1aP49586 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcyt1aP49586 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcyt1aP49586 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcyt1aP49586 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcyt1aP49586 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcyt1aP49586 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcyt1aP49586 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcyt1aP49586 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcyt1aP49586 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcyt1aP49586 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcyt1aP49586 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcyt1aP49586 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcyt1aP49586 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcyt1aP49586 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcyt1aP49586 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcyt1aP49586 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcyt1aP49586 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcyt1aP49586 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcyt1aP49586 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcyt1aP49586 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcyt1aP49586 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcyt1aP49586 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcyt1aP49586 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcyt1aP49586 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcyt1aP49586 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcyt1aP49586 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcyt1aP49586 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcyt1aP49586 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcyt1aP49586 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcyt1aP49586 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcyt1aP49586 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcyt1aP49586 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcyt1aP49586 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcyt1aP49586 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcyt1aP49586 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcyt1aP49586 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcyt1aP49586 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms