Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LmnaP48678 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LmnaP48678 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LmnaP48678 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LmnaP48678 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LmnaP48678 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LmnaP48678 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LmnaP48678 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LmnaP48678 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LmnaP48678 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LmnaP48678 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LmnaP48678 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LmnaP48678 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LmnaP48678 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LmnaP48678 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LmnaP48678 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LmnaP48678 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LmnaP48678 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LmnaP48678 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LmnaP48678 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LmnaP48678 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LmnaP48678 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LmnaP48678 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LmnaP48678 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LmnaP48678 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LmnaP48678 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LmnaP48678 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LmnaP48678 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LmnaP48678 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LmnaP48678 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LmnaP48678 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LmnaP48678 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LmnaP48678 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LmnaP48678 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LmnaP48678 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LmnaP48678 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LmnaP48678 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LmnaP48678 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LmnaP48678 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LmnaP48678 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LmnaP48678 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LmnaP48678 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LmnaP48678 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LmnaP48678 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LmnaP48678 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LmnaP48678 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LmnaP48678 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LmnaP48678 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LmnaP48678 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LmnaP48678 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LmnaP48678 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LmnaP48678 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LmnaP48678 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LmnaP48678 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LmnaP48678 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LmnaP48678 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LmnaP48678 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LmnaP48678 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LmnaP48678 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LmnaP48678 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LmnaP48678 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LmnaP48678 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LmnaP48678 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LmnaP48678 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LmnaP48678 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LmnaP48678 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LmnaP48678 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LmnaP48678 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LmnaP48678 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LmnaP48678 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LmnaP48678 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LmnaP48678 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LmnaP48678 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LmnaP48678 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LmnaP48678 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LmnaP48678 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LmnaP48678 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LmnaP48678 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LmnaP48678 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LmnaP48678 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LmnaP48678 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LmnaP48678 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LmnaP48678 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LmnaP48678 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LmnaP48678 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LmnaP48678 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LmnaP48678 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LmnaP48678 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LmnaP48678 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LmnaP48678 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LmnaP48678 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LmnaP48678 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LmnaP48678 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LmnaP48678 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LmnaP48678 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LmnaP48678 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LmnaP48678 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LmnaP48678 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LmnaP48678 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LmnaP48678 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms