Protein–RNA interactions for Protein: P41216

Acsl1, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl1P41216 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Acsl1P41216 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Acsl1P41216 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Acsl1P41216 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Acsl1P41216 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Acsl1P41216 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Acsl1P41216 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Acsl1P41216 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Acsl1P41216 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Acsl1P41216 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Acsl1P41216 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Acsl1P41216 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Acsl1P41216 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Acsl1P41216 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Acsl1P41216 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Acsl1P41216 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Acsl1P41216 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Acsl1P41216 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Acsl1P41216 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Acsl1P41216 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Acsl1P41216 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Acsl1P41216 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Acsl1P41216 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Acsl1P41216 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Acsl1P41216 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Acsl1P41216 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Acsl1P41216 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Acsl1P41216 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Acsl1P41216 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Acsl1P41216 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Acsl1P41216 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Acsl1P41216 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Acsl1P41216 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Acsl1P41216 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Acsl1P41216 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Acsl1P41216 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Acsl1P41216 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Acsl1P41216 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Acsl1P41216 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Acsl1P41216 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Acsl1P41216 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Acsl1P41216 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Acsl1P41216 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Acsl1P41216 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Acsl1P41216 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Acsl1P41216 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Acsl1P41216 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Acsl1P41216 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Acsl1P41216 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Acsl1P41216 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Acsl1P41216 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Acsl1P41216 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Acsl1P41216 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Acsl1P41216 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Acsl1P41216 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Acsl1P41216 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Acsl1P41216 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Acsl1P41216 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Acsl1P41216 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Acsl1P41216 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Acsl1P41216 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Acsl1P41216 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Acsl1P41216 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Acsl1P41216 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Acsl1P41216 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Acsl1P41216 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Acsl1P41216 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Acsl1P41216 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Acsl1P41216 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Acsl1P41216 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Acsl1P41216 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Acsl1P41216 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Acsl1P41216 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Acsl1P41216 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Acsl1P41216 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Acsl1P41216 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Acsl1P41216 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Acsl1P41216 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Acsl1P41216 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Acsl1P41216 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Acsl1P41216 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Acsl1P41216 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Acsl1P41216 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Acsl1P41216 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Acsl1P41216 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Acsl1P41216 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Acsl1P41216 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Acsl1P41216 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Acsl1P41216 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Acsl1P41216 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Acsl1P41216 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Acsl1P41216 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Acsl1P41216 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Acsl1P41216 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Acsl1P41216 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Acsl1P41216 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Acsl1P41216 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Acsl1P41216 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Acsl1P41216 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Acsl1P41216 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms