Protein–RNA interactions for Protein: P32115

Pax4, Paired box protein Pax-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax4P32115 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pax4P32115 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pax4P32115 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pax4P32115 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pax4P32115 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pax4P32115 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pax4P32115 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pax4P32115 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pax4P32115 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pax4P32115 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pax4P32115 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pax4P32115 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pax4P32115 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pax4P32115 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pax4P32115 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pax4P32115 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Pax4P32115 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pax4P32115 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pax4P32115 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pax4P32115 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pax4P32115 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Pax4P32115 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pax4P32115 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pax4P32115 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pax4P32115 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pax4P32115 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pax4P32115 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pax4P32115 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pax4P32115 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pax4P32115 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pax4P32115 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pax4P32115 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pax4P32115 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pax4P32115 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pax4P32115 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pax4P32115 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pax4P32115 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pax4P32115 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pax4P32115 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pax4P32115 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pax4P32115 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pax4P32115 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pax4P32115 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pax4P32115 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pax4P32115 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pax4P32115 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pax4P32115 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pax4P32115 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pax4P32115 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pax4P32115 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pax4P32115 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pax4P32115 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Pax4P32115 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pax4P32115 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pax4P32115 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pax4P32115 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pax4P32115 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pax4P32115 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pax4P32115 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pax4P32115 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pax4P32115 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pax4P32115 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pax4P32115 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pax4P32115 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pax4P32115 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pax4P32115 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pax4P32115 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pax4P32115 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pax4P32115 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pax4P32115 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pax4P32115 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pax4P32115 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pax4P32115 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pax4P32115 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pax4P32115 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pax4P32115 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pax4P32115 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pax4P32115 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pax4P32115 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pax4P32115 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pax4P32115 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pax4P32115 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pax4P32115 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pax4P32115 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pax4P32115 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pax4P32115 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pax4P32115 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pax4P32115 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pax4P32115 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pax4P32115 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pax4P32115 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pax4P32115 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pax4P32115 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pax4P32115 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pax4P32115 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pax4P32115 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pax4P32115 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pax4P32115 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pax4P32115 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pax4P32115 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms