Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ctnnd1P30999 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ctnnd1P30999 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Ctnnd1P30999 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Ctnnd1P30999 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ctnnd1P30999 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ctnnd1P30999 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ctnnd1P30999 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ctnnd1P30999 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ctnnd1P30999 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ctnnd1P30999 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ctnnd1P30999 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ctnnd1P30999 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ctnnd1P30999 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ctnnd1P30999 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ctnnd1P30999 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ctnnd1P30999 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ctnnd1P30999 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ctnnd1P30999 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ctnnd1P30999 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ctnnd1P30999 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ctnnd1P30999 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ctnnd1P30999 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ctnnd1P30999 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ctnnd1P30999 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ctnnd1P30999 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ctnnd1P30999 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ctnnd1P30999 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ctnnd1P30999 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ctnnd1P30999 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ctnnd1P30999 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ctnnd1P30999 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ctnnd1P30999 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ctnnd1P30999 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ctnnd1P30999 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ctnnd1P30999 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ctnnd1P30999 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ctnnd1P30999 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ctnnd1P30999 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ctnnd1P30999 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ctnnd1P30999 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ctnnd1P30999 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ctnnd1P30999 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ctnnd1P30999 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ctnnd1P30999 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ctnnd1P30999 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ctnnd1P30999 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ctnnd1P30999 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ctnnd1P30999 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ctnnd1P30999 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ctnnd1P30999 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ctnnd1P30999 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ctnnd1P30999 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ctnnd1P30999 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ctnnd1P30999 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ctnnd1P30999 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ctnnd1P30999 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ctnnd1P30999 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ctnnd1P30999 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ctnnd1P30999 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ctnnd1P30999 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ctnnd1P30999 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ctnnd1P30999 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ctnnd1P30999 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ctnnd1P30999 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ctnnd1P30999 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ctnnd1P30999 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ctnnd1P30999 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ctnnd1P30999 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ctnnd1P30999 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ctnnd1P30999 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ctnnd1P30999 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ctnnd1P30999 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ctnnd1P30999 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Ctnnd1P30999 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ctnnd1P30999 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ctnnd1P30999 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ctnnd1P30999 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ctnnd1P30999 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ctnnd1P30999 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ctnnd1P30999 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ctnnd1P30999 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ctnnd1P30999 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ctnnd1P30999 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ctnnd1P30999 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ctnnd1P30999 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ctnnd1P30999 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ctnnd1P30999 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ctnnd1P30999 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ctnnd1P30999 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ctnnd1P30999 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ctnnd1P30999 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ctnnd1P30999 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ctnnd1P30999 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ctnnd1P30999 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ctnnd1P30999 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ctnnd1P30999 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ctnnd1P30999 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ctnnd1P30999 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ctnnd1P30999 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms