Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LoxP28301 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LoxP28301 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LoxP28301 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LoxP28301 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LoxP28301 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LoxP28301 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LoxP28301 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LoxP28301 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LoxP28301 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LoxP28301 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LoxP28301 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LoxP28301 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LoxP28301 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LoxP28301 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LoxP28301 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LoxP28301 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LoxP28301 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LoxP28301 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LoxP28301 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LoxP28301 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LoxP28301 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LoxP28301 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LoxP28301 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LoxP28301 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LoxP28301 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LoxP28301 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LoxP28301 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LoxP28301 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LoxP28301 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LoxP28301 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
LoxP28301 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LoxP28301 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LoxP28301 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
LoxP28301 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LoxP28301 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LoxP28301 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LoxP28301 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LoxP28301 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LoxP28301 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LoxP28301 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LoxP28301 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LoxP28301 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LoxP28301 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LoxP28301 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
LoxP28301 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
LoxP28301 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
LoxP28301 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LoxP28301 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LoxP28301 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LoxP28301 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LoxP28301 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
LoxP28301 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LoxP28301 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LoxP28301 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LoxP28301 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LoxP28301 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LoxP28301 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LoxP28301 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LoxP28301 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LoxP28301 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LoxP28301 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LoxP28301 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LoxP28301 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LoxP28301 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LoxP28301 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
LoxP28301 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LoxP28301 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LoxP28301 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LoxP28301 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LoxP28301 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LoxP28301 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LoxP28301 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LoxP28301 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LoxP28301 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LoxP28301 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LoxP28301 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
LoxP28301 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LoxP28301 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LoxP28301 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LoxP28301 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LoxP28301 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LoxP28301 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
LoxP28301 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LoxP28301 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LoxP28301 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LoxP28301 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LoxP28301 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LoxP28301 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LoxP28301 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LoxP28301 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LoxP28301 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LoxP28301 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LoxP28301 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LoxP28301 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LoxP28301 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LoxP28301 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LoxP28301 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LoxP28301 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LoxP28301 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127 ms