Protein–RNA interactions for Protein: P26011

Itgb7, Integrin beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb7P26011 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Itgb7P26011 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Itgb7P26011 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Itgb7P26011 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Itgb7P26011 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Itgb7P26011 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Itgb7P26011 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Itgb7P26011 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Itgb7P26011 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Itgb7P26011 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Itgb7P26011 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Itgb7P26011 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Itgb7P26011 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Itgb7P26011 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Itgb7P26011 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Itgb7P26011 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Itgb7P26011 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Itgb7P26011 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Itgb7P26011 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Itgb7P26011 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Itgb7P26011 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Itgb7P26011 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Itgb7P26011 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Itgb7P26011 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Itgb7P26011 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Itgb7P26011 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Itgb7P26011 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Itgb7P26011 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Itgb7P26011 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Itgb7P26011 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Itgb7P26011 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Itgb7P26011 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Itgb7P26011 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Itgb7P26011 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Itgb7P26011 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Itgb7P26011 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Itgb7P26011 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Itgb7P26011 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Itgb7P26011 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Itgb7P26011 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Itgb7P26011 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Itgb7P26011 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Itgb7P26011 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Itgb7P26011 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Itgb7P26011 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Itgb7P26011 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Itgb7P26011 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Itgb7P26011 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Itgb7P26011 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Itgb7P26011 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Itgb7P26011 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Itgb7P26011 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Itgb7P26011 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Itgb7P26011 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Itgb7P26011 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Itgb7P26011 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Itgb7P26011 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Itgb7P26011 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Itgb7P26011 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Itgb7P26011 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Itgb7P26011 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Itgb7P26011 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Itgb7P26011 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Itgb7P26011 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Itgb7P26011 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Itgb7P26011 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Itgb7P26011 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Itgb7P26011 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Itgb7P26011 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Itgb7P26011 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Itgb7P26011 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Itgb7P26011 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Itgb7P26011 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Itgb7P26011 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Itgb7P26011 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Itgb7P26011 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Itgb7P26011 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Itgb7P26011 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Itgb7P26011 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Itgb7P26011 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Itgb7P26011 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Itgb7P26011 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Itgb7P26011 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Itgb7P26011 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Itgb7P26011 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Itgb7P26011 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Itgb7P26011 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Itgb7P26011 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Itgb7P26011 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Itgb7P26011 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Itgb7P26011 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Itgb7P26011 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Itgb7P26011 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Itgb7P26011 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Itgb7P26011 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Itgb7P26011 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Itgb7P26011 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Itgb7P26011 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Itgb7P26011 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Itgb7P26011 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms