Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccnd1P25322 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccnd1P25322 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccnd1P25322 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccnd1P25322 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccnd1P25322 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccnd1P25322 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccnd1P25322 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccnd1P25322 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccnd1P25322 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccnd1P25322 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccnd1P25322 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccnd1P25322 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccnd1P25322 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccnd1P25322 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccnd1P25322 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccnd1P25322 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccnd1P25322 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccnd1P25322 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccnd1P25322 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccnd1P25322 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccnd1P25322 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccnd1P25322 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccnd1P25322 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccnd1P25322 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccnd1P25322 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccnd1P25322 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccnd1P25322 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccnd1P25322 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccnd1P25322 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccnd1P25322 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccnd1P25322 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccnd1P25322 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccnd1P25322 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccnd1P25322 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccnd1P25322 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccnd1P25322 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccnd1P25322 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccnd1P25322 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccnd1P25322 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccnd1P25322 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccnd1P25322 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccnd1P25322 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccnd1P25322 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccnd1P25322 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccnd1P25322 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccnd1P25322 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccnd1P25322 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccnd1P25322 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccnd1P25322 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccnd1P25322 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccnd1P25322 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccnd1P25322 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccnd1P25322 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccnd1P25322 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccnd1P25322 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccnd1P25322 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccnd1P25322 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccnd1P25322 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccnd1P25322 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccnd1P25322 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccnd1P25322 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccnd1P25322 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccnd1P25322 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccnd1P25322 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccnd1P25322 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccnd1P25322 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccnd1P25322 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccnd1P25322 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccnd1P25322 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccnd1P25322 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccnd1P25322 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccnd1P25322 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccnd1P25322 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccnd1P25322 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccnd1P25322 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccnd1P25322 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccnd1P25322 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccnd1P25322 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccnd1P25322 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccnd1P25322 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccnd1P25322 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccnd1P25322 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccnd1P25322 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccnd1P25322 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccnd1P25322 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccnd1P25322 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccnd1P25322 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccnd1P25322 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccnd1P25322 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccnd1P25322 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccnd1P25322 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccnd1P25322 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccnd1P25322 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccnd1P25322 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccnd1P25322 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccnd1P25322 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccnd1P25322 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccnd1P25322 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccnd1P25322 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.2 ms