Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tsta3P23591 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tsta3P23591 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Tsta3P23591 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tsta3P23591 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tsta3P23591 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tsta3P23591 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tsta3P23591 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tsta3P23591 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tsta3P23591 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Tsta3P23591 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tsta3P23591 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tsta3P23591 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Tsta3P23591 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tsta3P23591 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Tsta3P23591 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tsta3P23591 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tsta3P23591 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tsta3P23591 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tsta3P23591 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tsta3P23591 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tsta3P23591 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tsta3P23591 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tsta3P23591 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tsta3P23591 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tsta3P23591 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tsta3P23591 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tsta3P23591 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tsta3P23591 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tsta3P23591 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tsta3P23591 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tsta3P23591 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tsta3P23591 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tsta3P23591 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tsta3P23591 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tsta3P23591 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tsta3P23591 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Tsta3P23591 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tsta3P23591 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tsta3P23591 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tsta3P23591 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tsta3P23591 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Tsta3P23591 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tsta3P23591 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tsta3P23591 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tsta3P23591 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tsta3P23591 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tsta3P23591 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tsta3P23591 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Tsta3P23591 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tsta3P23591 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tsta3P23591 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tsta3P23591 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tsta3P23591 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tsta3P23591 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tsta3P23591 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tsta3P23591 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tsta3P23591 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tsta3P23591 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tsta3P23591 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tsta3P23591 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tsta3P23591 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tsta3P23591 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tsta3P23591 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tsta3P23591 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tsta3P23591 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tsta3P23591 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tsta3P23591 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tsta3P23591 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tsta3P23591 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Tsta3P23591 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tsta3P23591 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tsta3P23591 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tsta3P23591 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tsta3P23591 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tsta3P23591 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tsta3P23591 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tsta3P23591 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tsta3P23591 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tsta3P23591 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tsta3P23591 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tsta3P23591 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tsta3P23591 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tsta3P23591 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Tsta3P23591 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tsta3P23591 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tsta3P23591 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tsta3P23591 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tsta3P23591 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Tsta3P23591 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tsta3P23591 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tsta3P23591 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tsta3P23591 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tsta3P23591 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tsta3P23591 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tsta3P23591 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tsta3P23591 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tsta3P23591 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tsta3P23591 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tsta3P23591 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms