Protein–RNA interactions for Protein: P20863

Gdf1, Embryonic growth/differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf1P20863 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gdf1P20863 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gdf1P20863 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gdf1P20863 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gdf1P20863 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gdf1P20863 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gdf1P20863 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gdf1P20863 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdf1P20863 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdf1P20863 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdf1P20863 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gdf1P20863 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gdf1P20863 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gdf1P20863 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gdf1P20863 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gdf1P20863 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gdf1P20863 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gdf1P20863 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gdf1P20863 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gdf1P20863 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gdf1P20863 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gdf1P20863 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gdf1P20863 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gdf1P20863 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gdf1P20863 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Gdf1P20863 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gdf1P20863 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdf1P20863 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdf1P20863 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdf1P20863 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdf1P20863 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdf1P20863 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gdf1P20863 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdf1P20863 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gdf1P20863 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdf1P20863 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdf1P20863 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gdf1P20863 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdf1P20863 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gdf1P20863 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gdf1P20863 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gdf1P20863 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdf1P20863 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdf1P20863 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdf1P20863 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdf1P20863 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdf1P20863 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdf1P20863 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdf1P20863 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdf1P20863 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdf1P20863 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdf1P20863 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gdf1P20863 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdf1P20863 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdf1P20863 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gdf1P20863 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdf1P20863 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdf1P20863 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdf1P20863 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdf1P20863 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdf1P20863 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdf1P20863 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gdf1P20863 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gdf1P20863 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gdf1P20863 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gdf1P20863 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gdf1P20863 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gdf1P20863 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gdf1P20863 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gdf1P20863 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gdf1P20863 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gdf1P20863 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gdf1P20863 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gdf1P20863 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gdf1P20863 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gdf1P20863 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gdf1P20863 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gdf1P20863 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gdf1P20863 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gdf1P20863 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdf1P20863 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gdf1P20863 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gdf1P20863 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gdf1P20863 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gdf1P20863 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gdf1P20863 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gdf1P20863 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gdf1P20863 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gdf1P20863 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gdf1P20863 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gdf1P20863 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gdf1P20863 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdf1P20863 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gdf1P20863 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gdf1P20863 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gdf1P20863 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gdf1P20863 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gdf1P20863 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gdf1P20863 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gdf1P20863 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms