Protein–RNA interactions for Protein: P17534

Defa-rs2, Alpha-defensin-related sequence 2, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs2P17534 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Defa-rs2P17534 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Defa-rs2P17534 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Defa-rs2P17534 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Defa-rs2P17534 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Defa-rs2P17534 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Defa-rs2P17534 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Defa-rs2P17534 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Defa-rs2P17534 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Defa-rs2P17534 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Defa-rs2P17534 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Defa-rs2P17534 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Defa-rs2P17534 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Defa-rs2P17534 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Defa-rs2P17534 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Defa-rs2P17534 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Defa-rs2P17534 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Defa-rs2P17534 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Defa-rs2P17534 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Defa-rs2P17534 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Defa-rs2P17534 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Defa-rs2P17534 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Defa-rs2P17534 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Defa-rs2P17534 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Defa-rs2P17534 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Defa-rs2P17534 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Defa-rs2P17534 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Defa-rs2P17534 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Defa-rs2P17534 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Defa-rs2P17534 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Defa-rs2P17534 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Defa-rs2P17534 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Defa-rs2P17534 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Defa-rs2P17534 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Defa-rs2P17534 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Defa-rs2P17534 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Defa-rs2P17534 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Defa-rs2P17534 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Defa-rs2P17534 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Defa-rs2P17534 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Defa-rs2P17534 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Defa-rs2P17534 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Defa-rs2P17534 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Defa-rs2P17534 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Defa-rs2P17534 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Defa-rs2P17534 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Defa-rs2P17534 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Defa-rs2P17534 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Defa-rs2P17534 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Defa-rs2P17534 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Defa-rs2P17534 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Defa-rs2P17534 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Defa-rs2P17534 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Defa-rs2P17534 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Defa-rs2P17534 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Defa-rs2P17534 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Defa-rs2P17534 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Defa-rs2P17534 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Defa-rs2P17534 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Defa-rs2P17534 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Defa-rs2P17534 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Defa-rs2P17534 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Defa-rs2P17534 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Defa-rs2P17534 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Defa-rs2P17534 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Defa-rs2P17534 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Defa-rs2P17534 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Defa-rs2P17534 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Defa-rs2P17534 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Defa-rs2P17534 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Defa-rs2P17534 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Defa-rs2P17534 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Defa-rs2P17534 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Defa-rs2P17534 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Defa-rs2P17534 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Defa-rs2P17534 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Defa-rs2P17534 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Defa-rs2P17534 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Defa-rs2P17534 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Defa-rs2P17534 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Defa-rs2P17534 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Defa-rs2P17534 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Defa-rs2P17534 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Defa-rs2P17534 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Defa-rs2P17534 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Defa-rs2P17534 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Defa-rs2P17534 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Defa-rs2P17534 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Defa-rs2P17534 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Defa-rs2P17534 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Defa-rs2P17534 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Defa-rs2P17534 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Defa-rs2P17534 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Defa-rs2P17534 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Defa-rs2P17534 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Defa-rs2P17534 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Defa-rs2P17534 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Defa-rs2P17534 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Defa-rs2P17534 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Defa-rs2P17534 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms