Protein–RNA interactions for Protein: P16092

Fgfr1, Fibroblast growth factor receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr1P16092 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fgfr1P16092 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Fgfr1P16092 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fgfr1P16092 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Fgfr1P16092 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Fgfr1P16092 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Fgfr1P16092 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Fgfr1P16092 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fgfr1P16092 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fgfr1P16092 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Fgfr1P16092 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fgfr1P16092 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fgfr1P16092 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fgfr1P16092 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fgfr1P16092 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Fgfr1P16092 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Fgfr1P16092 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Fgfr1P16092 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Fgfr1P16092 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fgfr1P16092 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Fgfr1P16092 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fgfr1P16092 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Fgfr1P16092 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fgfr1P16092 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fgfr1P16092 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Fgfr1P16092 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Fgfr1P16092 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fgfr1P16092 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Fgfr1P16092 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Fgfr1P16092 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Fgfr1P16092 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Fgfr1P16092 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Fgfr1P16092 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fgfr1P16092 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fgfr1P16092 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fgfr1P16092 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Fgfr1P16092 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Fgfr1P16092 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Fgfr1P16092 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Fgfr1P16092 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Fgfr1P16092 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Fgfr1P16092 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Fgfr1P16092 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Fgfr1P16092 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Fgfr1P16092 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Fgfr1P16092 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Fgfr1P16092 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Fgfr1P16092 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Fgfr1P16092 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Fgfr1P16092 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Fgfr1P16092 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Fgfr1P16092 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Fgfr1P16092 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fgfr1P16092 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fgfr1P16092 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fgfr1P16092 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Fgfr1P16092 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Fgfr1P16092 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fgfr1P16092 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fgfr1P16092 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fgfr1P16092 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fgfr1P16092 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fgfr1P16092 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Fgfr1P16092 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fgfr1P16092 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fgfr1P16092 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fgfr1P16092 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fgfr1P16092 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fgfr1P16092 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fgfr1P16092 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fgfr1P16092 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fgfr1P16092 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fgfr1P16092 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fgfr1P16092 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fgfr1P16092 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fgfr1P16092 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fgfr1P16092 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fgfr1P16092 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fgfr1P16092 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fgfr1P16092 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fgfr1P16092 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fgfr1P16092 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fgfr1P16092 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fgfr1P16092 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Fgfr1P16092 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fgfr1P16092 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fgfr1P16092 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fgfr1P16092 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Fgfr1P16092 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fgfr1P16092 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fgfr1P16092 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fgfr1P16092 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fgfr1P16092 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fgfr1P16092 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fgfr1P16092 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fgfr1P16092 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fgfr1P16092 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fgfr1P16092 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fgfr1P16092 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fgfr1P16092 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms