Protein–RNA interactions for Protein: P15508

Sptb, Spectrin beta chain, erythrocytic, mousemouse

Predictions only

Length 2,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptbP15508 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SptbP15508 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SptbP15508 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SptbP15508 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SptbP15508 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SptbP15508 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SptbP15508 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SptbP15508 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SptbP15508 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SptbP15508 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SptbP15508 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SptbP15508 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SptbP15508 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SptbP15508 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SptbP15508 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SptbP15508 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SptbP15508 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SptbP15508 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SptbP15508 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SptbP15508 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SptbP15508 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
SptbP15508 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SptbP15508 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SptbP15508 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SptbP15508 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SptbP15508 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SptbP15508 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SptbP15508 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SptbP15508 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SptbP15508 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SptbP15508 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SptbP15508 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SptbP15508 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SptbP15508 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SptbP15508 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SptbP15508 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SptbP15508 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SptbP15508 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SptbP15508 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SptbP15508 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SptbP15508 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SptbP15508 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SptbP15508 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SptbP15508 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SptbP15508 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SptbP15508 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SptbP15508 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SptbP15508 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SptbP15508 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SptbP15508 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SptbP15508 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SptbP15508 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SptbP15508 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SptbP15508 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SptbP15508 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SptbP15508 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SptbP15508 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SptbP15508 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SptbP15508 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SptbP15508 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SptbP15508 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SptbP15508 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SptbP15508 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SptbP15508 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SptbP15508 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SptbP15508 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SptbP15508 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SptbP15508 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SptbP15508 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SptbP15508 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SptbP15508 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SptbP15508 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SptbP15508 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SptbP15508 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SptbP15508 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SptbP15508 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SptbP15508 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SptbP15508 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SptbP15508 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SptbP15508 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SptbP15508 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SptbP15508 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SptbP15508 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SptbP15508 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SptbP15508 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SptbP15508 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SptbP15508 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SptbP15508 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SptbP15508 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SptbP15508 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SptbP15508 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SptbP15508 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SptbP15508 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SptbP15508 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SptbP15508 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SptbP15508 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SptbP15508 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SptbP15508 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SptbP15508 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SptbP15508 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms