Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Itgb1P09055 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Itgb1P09055 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Itgb1P09055 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Itgb1P09055 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Itgb1P09055 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Itgb1P09055 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Itgb1P09055 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Itgb1P09055 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Itgb1P09055 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Itgb1P09055 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Itgb1P09055 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Itgb1P09055 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Itgb1P09055 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Itgb1P09055 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Itgb1P09055 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Itgb1P09055 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Itgb1P09055 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Itgb1P09055 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Itgb1P09055 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Itgb1P09055 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Itgb1P09055 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Itgb1P09055 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Itgb1P09055 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Itgb1P09055 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Itgb1P09055 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Itgb1P09055 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Itgb1P09055 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Itgb1P09055 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Itgb1P09055 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Itgb1P09055 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Itgb1P09055 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Itgb1P09055 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Itgb1P09055 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Itgb1P09055 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Itgb1P09055 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Itgb1P09055 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Itgb1P09055 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Itgb1P09055 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Itgb1P09055 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Itgb1P09055 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Itgb1P09055 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Itgb1P09055 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Itgb1P09055 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Itgb1P09055 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Itgb1P09055 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Itgb1P09055 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Itgb1P09055 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Itgb1P09055 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Itgb1P09055 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Itgb1P09055 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Itgb1P09055 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Itgb1P09055 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Itgb1P09055 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Itgb1P09055 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Itgb1P09055 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Itgb1P09055 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Itgb1P09055 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Itgb1P09055 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Itgb1P09055 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Itgb1P09055 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Itgb1P09055 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Itgb1P09055 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Itgb1P09055 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Itgb1P09055 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Itgb1P09055 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Itgb1P09055 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Itgb1P09055 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Itgb1P09055 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Itgb1P09055 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Itgb1P09055 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Itgb1P09055 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Itgb1P09055 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Itgb1P09055 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Itgb1P09055 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Itgb1P09055 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Itgb1P09055 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Itgb1P09055 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Itgb1P09055 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Itgb1P09055 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Itgb1P09055 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Itgb1P09055 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Itgb1P09055 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Itgb1P09055 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Itgb1P09055 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Itgb1P09055 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Itgb1P09055 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Itgb1P09055 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Itgb1P09055 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Itgb1P09055 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Itgb1P09055 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Itgb1P09055 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Itgb1P09055 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Itgb1P09055 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Itgb1P09055 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Itgb1P09055 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Itgb1P09055 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Itgb1P09055 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Itgb1P09055 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Itgb1P09055 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms