Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Hoxb7P09024 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Hoxb7P09024 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Hoxb7P09024 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Hoxb7P09024 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Hoxb7P09024 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Hoxb7P09024 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Hoxb7P09024 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
Hoxb7P09024 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Hoxb7P09024 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Hoxb7P09024 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Hoxb7P09024 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Hoxb7P09024 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Hoxb7P09024 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Hoxb7P09024 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Hoxb7P09024 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Hoxb7P09024 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Hoxb7P09024 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Hoxb7P09024 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Hoxb7P09024 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Hoxb7P09024 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Hoxb7P09024 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Hoxb7P09024 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Hoxb7P09024 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Hoxb7P09024 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Hoxb7P09024 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Hoxb7P09024 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Hoxb7P09024 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Hoxb7P09024 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Hoxb7P09024 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Hoxb7P09024 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Hoxb7P09024 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Hoxb7P09024 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Hoxb7P09024 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Hoxb7P09024 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Hoxb7P09024 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Hoxb7P09024 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Hoxb7P09024 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Hoxb7P09024 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Hoxb7P09024 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Hoxb7P09024 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Hoxb7P09024 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Hoxb7P09024 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Hoxb7P09024 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Hoxb7P09024 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Hoxb7P09024 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Hoxb7P09024 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Hoxb7P09024 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Hoxb7P09024 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Hoxb7P09024 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Hoxb7P09024 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Hoxb7P09024 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Hoxb7P09024 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Hoxb7P09024 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Hoxb7P09024 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Hoxb7P09024 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Hoxb7P09024 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Hoxb7P09024 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Hoxb7P09024 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Hoxb7P09024 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Hoxb7P09024 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Hoxb7P09024 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Hoxb7P09024 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Hoxb7P09024 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Hoxb7P09024 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Hoxb7P09024 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Hoxb7P09024 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Hoxb7P09024 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Hoxb7P09024 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Hoxb7P09024 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Hoxb7P09024 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Hoxb7P09024 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Hoxb7P09024 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Hoxb7P09024 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Hoxb7P09024 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Hoxb7P09024 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Hoxb7P09024 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Hoxb7P09024 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
Hoxb7P09024 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Hoxb7P09024 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Hoxb7P09024 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Hoxb7P09024 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Hoxb7P09024 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Hoxb7P09024 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Hoxb7P09024 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Hoxb7P09024 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Hoxb7P09024 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Hoxb7P09024 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Hoxb7P09024 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Hoxb7P09024 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Hoxb7P09024 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Hoxb7P09024 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Hoxb7P09024 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Hoxb7P09024 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Hoxb7P09024 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Hoxb7P09024 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Hoxb7P09024 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Hoxb7P09024 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Hoxb7P09024 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Hoxb7P09024 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.3 ms