Protein–RNA interactions for Protein: P08923

Ltk, Leukocyte tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtkP08923 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LtkP08923 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LtkP08923 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LtkP08923 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LtkP08923 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LtkP08923 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LtkP08923 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LtkP08923 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LtkP08923 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LtkP08923 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LtkP08923 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LtkP08923 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LtkP08923 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LtkP08923 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LtkP08923 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
LtkP08923 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LtkP08923 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LtkP08923 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LtkP08923 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LtkP08923 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LtkP08923 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LtkP08923 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LtkP08923 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
LtkP08923 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LtkP08923 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LtkP08923 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LtkP08923 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LtkP08923 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LtkP08923 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LtkP08923 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LtkP08923 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LtkP08923 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LtkP08923 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LtkP08923 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LtkP08923 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LtkP08923 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LtkP08923 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
LtkP08923 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LtkP08923 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
LtkP08923 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LtkP08923 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LtkP08923 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LtkP08923 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
LtkP08923 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LtkP08923 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LtkP08923 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LtkP08923 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LtkP08923 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LtkP08923 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LtkP08923 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LtkP08923 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LtkP08923 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LtkP08923 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LtkP08923 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LtkP08923 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LtkP08923 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LtkP08923 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LtkP08923 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LtkP08923 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LtkP08923 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LtkP08923 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LtkP08923 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LtkP08923 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LtkP08923 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LtkP08923 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LtkP08923 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LtkP08923 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LtkP08923 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LtkP08923 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
LtkP08923 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LtkP08923 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LtkP08923 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LtkP08923 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
LtkP08923 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LtkP08923 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LtkP08923 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LtkP08923 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LtkP08923 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LtkP08923 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LtkP08923 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LtkP08923 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LtkP08923 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LtkP08923 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LtkP08923 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LtkP08923 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LtkP08923 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LtkP08923 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LtkP08923 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
LtkP08923 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LtkP08923 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LtkP08923 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LtkP08923 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LtkP08923 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LtkP08923 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LtkP08923 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LtkP08923 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LtkP08923 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LtkP08923 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LtkP08923 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LtkP08923 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms