Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col4a2P08122 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col4a2P08122 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col4a2P08122 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col4a2P08122 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Col4a2P08122 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col4a2P08122 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col4a2P08122 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col4a2P08122 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col4a2P08122 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col4a2P08122 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col4a2P08122 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col4a2P08122 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col4a2P08122 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col4a2P08122 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col4a2P08122 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Col4a2P08122 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col4a2P08122 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Col4a2P08122 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col4a2P08122 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col4a2P08122 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col4a2P08122 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col4a2P08122 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col4a2P08122 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col4a2P08122 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col4a2P08122 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col4a2P08122 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col4a2P08122 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col4a2P08122 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col4a2P08122 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col4a2P08122 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col4a2P08122 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col4a2P08122 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col4a2P08122 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col4a2P08122 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col4a2P08122 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col4a2P08122 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col4a2P08122 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col4a2P08122 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col4a2P08122 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col4a2P08122 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col4a2P08122 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col4a2P08122 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col4a2P08122 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col4a2P08122 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col4a2P08122 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col4a2P08122 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col4a2P08122 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Col4a2P08122 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col4a2P08122 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col4a2P08122 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col4a2P08122 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col4a2P08122 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col4a2P08122 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Col4a2P08122 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col4a2P08122 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col4a2P08122 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Col4a2P08122 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col4a2P08122 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col4a2P08122 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col4a2P08122 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col4a2P08122 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col4a2P08122 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col4a2P08122 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col4a2P08122 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col4a2P08122 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col4a2P08122 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col4a2P08122 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col4a2P08122 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col4a2P08122 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col4a2P08122 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col4a2P08122 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col4a2P08122 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col4a2P08122 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col4a2P08122 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Col4a2P08122 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Col4a2P08122 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col4a2P08122 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col4a2P08122 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col4a2P08122 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col4a2P08122 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Col4a2P08122 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col4a2P08122 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col4a2P08122 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col4a2P08122 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col4a2P08122 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col4a2P08122 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col4a2P08122 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col4a2P08122 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col4a2P08122 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col4a2P08122 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col4a2P08122 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col4a2P08122 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col4a2P08122 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col4a2P08122 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col4a2P08122 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col4a2P08122 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col4a2P08122 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col4a2P08122 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col4a2P08122 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms