Protein–RNA interactions for Protein: P07310

Ckm, Creatine kinase M-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkmP07310 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CkmP07310 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CkmP07310 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CkmP07310 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CkmP07310 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CkmP07310 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CkmP07310 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CkmP07310 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CkmP07310 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CkmP07310 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CkmP07310 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CkmP07310 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CkmP07310 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CkmP07310 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CkmP07310 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CkmP07310 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CkmP07310 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CkmP07310 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CkmP07310 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CkmP07310 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CkmP07310 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CkmP07310 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CkmP07310 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CkmP07310 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CkmP07310 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CkmP07310 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CkmP07310 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CkmP07310 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CkmP07310 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CkmP07310 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CkmP07310 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CkmP07310 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CkmP07310 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CkmP07310 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CkmP07310 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CkmP07310 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CkmP07310 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CkmP07310 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CkmP07310 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CkmP07310 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CkmP07310 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CkmP07310 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CkmP07310 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CkmP07310 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CkmP07310 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CkmP07310 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CkmP07310 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CkmP07310 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CkmP07310 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CkmP07310 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CkmP07310 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CkmP07310 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CkmP07310 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CkmP07310 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CkmP07310 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CkmP07310 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CkmP07310 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CkmP07310 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CkmP07310 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CkmP07310 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CkmP07310 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CkmP07310 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CkmP07310 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CkmP07310 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CkmP07310 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CkmP07310 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CkmP07310 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CkmP07310 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CkmP07310 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CkmP07310 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CkmP07310 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CkmP07310 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CkmP07310 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CkmP07310 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CkmP07310 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CkmP07310 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CkmP07310 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CkmP07310 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CkmP07310 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CkmP07310 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CkmP07310 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CkmP07310 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CkmP07310 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CkmP07310 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CkmP07310 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CkmP07310 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CkmP07310 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CkmP07310 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CkmP07310 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CkmP07310 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CkmP07310 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CkmP07310 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CkmP07310 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CkmP07310 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CkmP07310 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CkmP07310 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CkmP07310 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CkmP07310 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CkmP07310 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CkmP07310 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms