Protein–RNA interactions for Protein: P01652

Ig kappa chain V-V region J606, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01652 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
P01652 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
P01652 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
P01652 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
P01652 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
P01652 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
P01652 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
P01652 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
P01652 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
P01652 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
P01652 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
P01652 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
P01652 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
P01652 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
P01652 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
P01652 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
P01652 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
P01652 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
P01652 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
P01652 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
P01652 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
P01652 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
P01652 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
P01652 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
P01652 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
P01652 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
P01652 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
P01652 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
P01652 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
P01652 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
P01652 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
P01652 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
P01652 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
P01652 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
P01652 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
P01652 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
P01652 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
P01652 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
P01652 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
P01652 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
P01652 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
P01652 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
P01652 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
P01652 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
P01652 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
P01652 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
P01652 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
P01652 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26■■□□□ 1.75
P01652 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
P01652 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
P01652 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
P01652 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
P01652 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
P01652 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
P01652 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
P01652 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
P01652 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
P01652 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
P01652 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
P01652 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
P01652 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
P01652 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
P01652 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
P01652 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
P01652 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
P01652 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
P01652 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
P01652 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
P01652 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
P01652 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
P01652 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
P01652 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
P01652 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
P01652 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
P01652 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
P01652 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
P01652 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
P01652 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
P01652 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
P01652 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
P01652 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
P01652 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
P01652 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
P01652 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
P01652 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
P01652 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
P01652 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
P01652 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
P01652 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
P01652 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
P01652 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
P01652 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
P01652 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
P01652 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
P01652 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
P01652 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
P01652 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
P01652 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
P01652 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
P01652 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms