Protein–RNA interactions for Protein: P00860

Odc1, Ornithine decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odc1P00860 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Odc1P00860 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Odc1P00860 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Odc1P00860 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Odc1P00860 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Odc1P00860 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Odc1P00860 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Odc1P00860 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Odc1P00860 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Odc1P00860 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Odc1P00860 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Odc1P00860 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Odc1P00860 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Odc1P00860 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Odc1P00860 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Odc1P00860 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Odc1P00860 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Odc1P00860 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Odc1P00860 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Odc1P00860 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Odc1P00860 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Odc1P00860 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Odc1P00860 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Odc1P00860 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Odc1P00860 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Odc1P00860 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Odc1P00860 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Odc1P00860 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Odc1P00860 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Odc1P00860 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Odc1P00860 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Odc1P00860 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Odc1P00860 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Odc1P00860 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Odc1P00860 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Odc1P00860 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Odc1P00860 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Odc1P00860 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Odc1P00860 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Odc1P00860 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Odc1P00860 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Odc1P00860 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Odc1P00860 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Odc1P00860 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Odc1P00860 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Odc1P00860 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Odc1P00860 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Odc1P00860 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Odc1P00860 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Odc1P00860 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Odc1P00860 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Odc1P00860 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Odc1P00860 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Odc1P00860 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Odc1P00860 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Odc1P00860 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Odc1P00860 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Odc1P00860 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Odc1P00860 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Odc1P00860 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Odc1P00860 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Odc1P00860 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Odc1P00860 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Odc1P00860 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Odc1P00860 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Odc1P00860 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Odc1P00860 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Odc1P00860 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Odc1P00860 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Odc1P00860 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Odc1P00860 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Odc1P00860 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Odc1P00860 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Odc1P00860 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Odc1P00860 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Odc1P00860 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Odc1P00860 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Odc1P00860 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Odc1P00860 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Odc1P00860 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Odc1P00860 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Odc1P00860 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Odc1P00860 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Odc1P00860 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Odc1P00860 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Odc1P00860 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Odc1P00860 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Odc1P00860 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Odc1P00860 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Odc1P00860 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Odc1P00860 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Odc1P00860 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Odc1P00860 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Odc1P00860 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Odc1P00860 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Odc1P00860 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Odc1P00860 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Odc1P00860 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Odc1P00860 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Odc1P00860 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms