Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CcnkO88874 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CcnkO88874 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CcnkO88874 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CcnkO88874 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CcnkO88874 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CcnkO88874 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CcnkO88874 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CcnkO88874 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CcnkO88874 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CcnkO88874 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CcnkO88874 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CcnkO88874 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CcnkO88874 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CcnkO88874 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CcnkO88874 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CcnkO88874 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CcnkO88874 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CcnkO88874 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CcnkO88874 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CcnkO88874 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CcnkO88874 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CcnkO88874 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CcnkO88874 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CcnkO88874 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CcnkO88874 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CcnkO88874 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CcnkO88874 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CcnkO88874 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CcnkO88874 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CcnkO88874 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CcnkO88874 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CcnkO88874 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CcnkO88874 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CcnkO88874 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CcnkO88874 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CcnkO88874 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CcnkO88874 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CcnkO88874 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CcnkO88874 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CcnkO88874 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CcnkO88874 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CcnkO88874 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CcnkO88874 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CcnkO88874 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CcnkO88874 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CcnkO88874 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CcnkO88874 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CcnkO88874 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CcnkO88874 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CcnkO88874 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CcnkO88874 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CcnkO88874 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CcnkO88874 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CcnkO88874 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CcnkO88874 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CcnkO88874 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CcnkO88874 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CcnkO88874 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CcnkO88874 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CcnkO88874 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CcnkO88874 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CcnkO88874 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CcnkO88874 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CcnkO88874 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CcnkO88874 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CcnkO88874 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CcnkO88874 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CcnkO88874 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CcnkO88874 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CcnkO88874 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CcnkO88874 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CcnkO88874 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CcnkO88874 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CcnkO88874 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CcnkO88874 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CcnkO88874 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CcnkO88874 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CcnkO88874 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CcnkO88874 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CcnkO88874 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CcnkO88874 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CcnkO88874 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CcnkO88874 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CcnkO88874 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CcnkO88874 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CcnkO88874 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CcnkO88874 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CcnkO88874 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CcnkO88874 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CcnkO88874 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CcnkO88874 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CcnkO88874 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CcnkO88874 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CcnkO88874 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CcnkO88874 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CcnkO88874 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CcnkO88874 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CcnkO88874 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CcnkO88874 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms