Protein–RNA interactions for Protein: O88708

Orc4, Origin recognition complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Orc4O88708 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Orc4O88708 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Orc4O88708 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Orc4O88708 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Orc4O88708 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Orc4O88708 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Orc4O88708 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Orc4O88708 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Orc4O88708 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Orc4O88708 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Orc4O88708 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Orc4O88708 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Orc4O88708 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Orc4O88708 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Orc4O88708 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Orc4O88708 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Orc4O88708 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Orc4O88708 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Orc4O88708 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Orc4O88708 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Orc4O88708 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Orc4O88708 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Orc4O88708 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Orc4O88708 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Orc4O88708 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Orc4O88708 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Orc4O88708 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Orc4O88708 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Orc4O88708 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Orc4O88708 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Orc4O88708 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Orc4O88708 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Orc4O88708 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Orc4O88708 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Orc4O88708 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Orc4O88708 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Orc4O88708 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Orc4O88708 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Orc4O88708 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Orc4O88708 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Orc4O88708 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Orc4O88708 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Orc4O88708 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Orc4O88708 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Orc4O88708 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Orc4O88708 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Orc4O88708 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Orc4O88708 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Orc4O88708 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Orc4O88708 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Orc4O88708 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Orc4O88708 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Orc4O88708 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Orc4O88708 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Orc4O88708 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Orc4O88708 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Orc4O88708 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Orc4O88708 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Orc4O88708 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Orc4O88708 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Orc4O88708 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Orc4O88708 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Orc4O88708 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Orc4O88708 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Orc4O88708 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Orc4O88708 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Orc4O88708 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Orc4O88708 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Orc4O88708 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Orc4O88708 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Orc4O88708 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Orc4O88708 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Orc4O88708 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Orc4O88708 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Orc4O88708 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Orc4O88708 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Orc4O88708 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Orc4O88708 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Orc4O88708 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Orc4O88708 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Orc4O88708 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Orc4O88708 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Orc4O88708 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Orc4O88708 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Orc4O88708 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Orc4O88708 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Orc4O88708 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Orc4O88708 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Orc4O88708 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Orc4O88708 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Orc4O88708 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Orc4O88708 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Orc4O88708 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Orc4O88708 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Orc4O88708 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Orc4O88708 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Orc4O88708 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Orc4O88708 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Orc4O88708 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Orc4O88708 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms