Protein–RNA interactions for Protein: O88572

Lrp6, Low-density lipoprotein receptor-related protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp6O88572 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Lrp6O88572 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Lrp6O88572 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Lrp6O88572 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Lrp6O88572 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Lrp6O88572 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Lrp6O88572 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Lrp6O88572 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Lrp6O88572 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Lrp6O88572 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Lrp6O88572 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Lrp6O88572 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Lrp6O88572 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Lrp6O88572 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Lrp6O88572 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Lrp6O88572 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Lrp6O88572 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Lrp6O88572 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Lrp6O88572 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3.01
Lrp6O88572 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
Lrp6O88572 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Lrp6O88572 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
Lrp6O88572 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Lrp6O88572 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Lrp6O88572 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
Lrp6O88572 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
Lrp6O88572 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Lrp6O88572 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Lrp6O88572 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Lrp6O88572 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Lrp6O88572 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Lrp6O88572 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Lrp6O88572 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Lrp6O88572 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Lrp6O88572 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Lrp6O88572 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Lrp6O88572 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Lrp6O88572 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Lrp6O88572 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Lrp6O88572 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Lrp6O88572 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Lrp6O88572 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Lrp6O88572 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Lrp6O88572 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Lrp6O88572 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Lrp6O88572 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Lrp6O88572 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Lrp6O88572 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Lrp6O88572 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Lrp6O88572 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Lrp6O88572 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Lrp6O88572 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Lrp6O88572 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Lrp6O88572 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Lrp6O88572 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Lrp6O88572 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Lrp6O88572 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Lrp6O88572 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Lrp6O88572 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Lrp6O88572 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Lrp6O88572 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Lrp6O88572 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Lrp6O88572 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Lrp6O88572 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Lrp6O88572 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Lrp6O88572 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Lrp6O88572 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Lrp6O88572 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Lrp6O88572 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Lrp6O88572 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Lrp6O88572 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Lrp6O88572 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Lrp6O88572 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Lrp6O88572 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Lrp6O88572 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Lrp6O88572 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Lrp6O88572 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Lrp6O88572 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Lrp6O88572 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Lrp6O88572 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Lrp6O88572 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Lrp6O88572 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Lrp6O88572 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Lrp6O88572 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Lrp6O88572 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Lrp6O88572 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.93
Lrp6O88572 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Lrp6O88572 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Lrp6O88572 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Lrp6O88572 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Lrp6O88572 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Lrp6O88572 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Lrp6O88572 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Lrp6O88572 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Lrp6O88572 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Lrp6O88572 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Lrp6O88572 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Lrp6O88572 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Lrp6O88572 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Lrp6O88572 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms