Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Dll3O88516 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dll3O88516 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dll3O88516 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dll3O88516 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dll3O88516 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dll3O88516 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dll3O88516 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dll3O88516 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dll3O88516 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dll3O88516 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dll3O88516 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dll3O88516 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dll3O88516 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dll3O88516 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dll3O88516 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Dll3O88516 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dll3O88516 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dll3O88516 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dll3O88516 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dll3O88516 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dll3O88516 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dll3O88516 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dll3O88516 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dll3O88516 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dll3O88516 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dll3O88516 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Dll3O88516 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dll3O88516 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dll3O88516 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dll3O88516 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dll3O88516 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dll3O88516 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dll3O88516 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dll3O88516 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Dll3O88516 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dll3O88516 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dll3O88516 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dll3O88516 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dll3O88516 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dll3O88516 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dll3O88516 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dll3O88516 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Dll3O88516 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Dll3O88516 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Dll3O88516 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Dll3O88516 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dll3O88516 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dll3O88516 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dll3O88516 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dll3O88516 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dll3O88516 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dll3O88516 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dll3O88516 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dll3O88516 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dll3O88516 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dll3O88516 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dll3O88516 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dll3O88516 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dll3O88516 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dll3O88516 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dll3O88516 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dll3O88516 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dll3O88516 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dll3O88516 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dll3O88516 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dll3O88516 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dll3O88516 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dll3O88516 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dll3O88516 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Dll3O88516 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dll3O88516 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dll3O88516 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dll3O88516 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dll3O88516 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dll3O88516 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dll3O88516 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dll3O88516 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dll3O88516 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dll3O88516 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dll3O88516 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dll3O88516 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dll3O88516 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dll3O88516 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dll3O88516 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dll3O88516 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dll3O88516 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dll3O88516 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Dll3O88516 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dll3O88516 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dll3O88516 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dll3O88516 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dll3O88516 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dll3O88516 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dll3O88516 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dll3O88516 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dll3O88516 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dll3O88516 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dll3O88516 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dll3O88516 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms