Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Dll3O88516 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dll3O88516 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dll3O88516 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dll3O88516 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dll3O88516 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dll3O88516 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dll3O88516 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dll3O88516 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dll3O88516 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dll3O88516 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dll3O88516 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dll3O88516 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dll3O88516 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dll3O88516 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dll3O88516 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Dll3O88516 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dll3O88516 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dll3O88516 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dll3O88516 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dll3O88516 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dll3O88516 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dll3O88516 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dll3O88516 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dll3O88516 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dll3O88516 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dll3O88516 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Dll3O88516 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dll3O88516 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dll3O88516 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dll3O88516 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dll3O88516 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dll3O88516 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dll3O88516 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dll3O88516 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Dll3O88516 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dll3O88516 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dll3O88516 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dll3O88516 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dll3O88516 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dll3O88516 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dll3O88516 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dll3O88516 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Dll3O88516 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Dll3O88516 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Dll3O88516 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Dll3O88516 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dll3O88516 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dll3O88516 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dll3O88516 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dll3O88516 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dll3O88516 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dll3O88516 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dll3O88516 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dll3O88516 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dll3O88516 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dll3O88516 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dll3O88516 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dll3O88516 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dll3O88516 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dll3O88516 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dll3O88516 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dll3O88516 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dll3O88516 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dll3O88516 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dll3O88516 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dll3O88516 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dll3O88516 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dll3O88516 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dll3O88516 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Dll3O88516 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dll3O88516 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dll3O88516 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dll3O88516 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dll3O88516 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dll3O88516 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dll3O88516 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dll3O88516 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dll3O88516 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dll3O88516 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dll3O88516 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dll3O88516 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dll3O88516 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dll3O88516 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dll3O88516 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dll3O88516 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dll3O88516 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dll3O88516 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Dll3O88516 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dll3O88516 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dll3O88516 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dll3O88516 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dll3O88516 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dll3O88516 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dll3O88516 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dll3O88516 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dll3O88516 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dll3O88516 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dll3O88516 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dll3O88516 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms